Партия создана в декабре 2019 года на базе одноименного общественного движения. Ее председателем стал экоактивист Руслан Хвостов. По результатам единственного выдвижения в Госдуму в 2021 году «Зеленая альтернатива» набрала 0,64% голосов. Благодаря избранию своих представителей в заксобрания двух регионов партия участвовала в выборах без сбора подписей. На настоящий момент у «Зеленой альтернативы» насчитывается 53 региональных отделения.
