A single-molecule method for measuring fluorophore labeling yields for the study of membrane protein oligomerization in membranes
by Melanie Ernst, Tugba N. Ozturk, Janice L. Robertson
Membrane proteins are often observed as higher-order oligomers, and in some cases in multiple stoichiometric forms, raising the question of whether dynamic oligomerization can be linked to modulation of function. To better understand this potential regulatory mechanism, there is an ongoing effort to quantify equilibrium reactions of membrane protein oligomerization directly in membranes. Single-molecule photobleaching analysis is particularly useful for this as it provides a binary readout of fluorophores attached to protein subunits at dilute conditions. However, any quantification of stoichiometry also critically requires knowing the probability that a subunit is fluorescently labeled. Since labeling uncertainty is often unavoidable, we developed an approach to estimate labeling yields using the photobleaching probability distribution of an intrinsic dimeric control. By iterative fitting of an experimental dimeric photobleaching probability distribution to an expected dimer model, we estimate the fluorophore labeling yields and find agreement with direct measurements of labeling of the purified protein by UV-VIS absorbance before reconstitution. Using this labeling prediction, similar estimation methods are applied to determine the dissociation constant of reactive CLC-ec1 dimerization constructs without prior knowledge of the fluorophore labeling yield. Finally, we estimate the operational range of subunit labeling yields that allows for discrimination of monomer and dimer populations across the reactive range of mole fraction densities. Thus, our study maps out a practical method for quantifying fluorophore labeling directly from single-molecule photobleaching data, improving the ability to quantify reactive membrane protein stoichiometry in membranes.
Рок-фестиваль «Окна Открой» в Петербурге: возвращение звезд и открытие новых талантов
«Прошли два удара»: Гребенщиков рассказал свою версию драки с Пирцхалавой
Яблоня Сиверса: как скромный аптекарь открыл прародительницу всех яблок
Клинический психолог Юлия Тарибо: психологические последствия удаленной работы и способы их преодоления
AI talent comes at a 30% salary premium: ‘If you try to play catch up later, this is going to cost you even more’
Cameroon star has said yes to Man Utd transfer but Red Devils face hurdle
Report: Liverpool decision hands advantage to Man United in midfielder pursuit
Palestinian envoy urges action at UN: “History will judge us all”
CorpSoft24 предоставил сервера для нужд машинного обучения
В Петербурге центр города и Лахтинскую гавань связали водными круизами
Антиармянские публикации в российском научном журнале «Современная научная мысль»: расследование фонда «Гегард»
Modders are trying their hardest to add an NVMe SSD to the Switch 2, which is both impressive and something I'm not going to do
New study shows that Gen Z is spending way less money on videogames than older gamers
Открыты сервера MMORPG ROM: Golden Age
Steam for Chromebooks is getting axed in 2026 instead of exiting its 4-year beta
Овочі можусть стати розкішшю для українців
Клинический психолог Юлия Тарибо: психологические последствия удаленной работы и способы их преодоления
Семейное приключение на «Кораблике Детского радио»
В регионах центральной России росгвардейцы отметили День физкультурника
Директор Росгвардии Герой России генерал армии Виктор Золотов принял участие в заседании Национального антитеррористического комитета
Грачья Погосян: достойный пример гуманизма и патриотизма (к 55-летию известного благотворителя)
RBNA ввела в эксплуатацию логистический комплекс
Антиармянские публикации в российском научном журнале «Современная научная мысль»: расследование фонда «Гегард»
Главный врач клиники микрохирургии глаза АйМед Элина Санторо: что делать если лопнул сосуд в глазу
Бывший наставник "Ахмата" получил предложение от иностранного клуба
Кредитный кризис: просрочка по ипотеке и автомобилям приблизилась за год к 100%
Уважаемые жители 913 корпуса!
«Обсудили план взаимодействия»: ветеран СВО начал работу в администрации Высокой Горы
Кудерметова победила Ламенс и прошла во второй круг турнира WTA 1000 в США
Калинская обыграла финалистку Уимблдона на турнире в Цинциннати
Теннисистка Калинская пробилась в третий круг турнира в Цинциннати
Андрей Рублёв обыграл Лёнера Тьена на старте «Мастерса» в Цинциннати
В Подмосковье девушка на моноколесе попала под грузовик
Миллионные долги и разбитые партнерства: судебные баталии Аллы Пугачевой
Жара вернется в сентябре с новой силой: россиянам рассказали, когда ждать бабье лето
Кредитный кризис: просрочка по ипотеке и автомобилям приблизилась за год к 100%
Музыкальные новости
Mash: Розенбаум может потерять голос на фоне пневмонии
Фадеев публикует редкие кадры знакомства с женой: «Для тех, кто не видел, как выглядит любовь с первого взгляда»
БЕСПЛАТНО ДЛЯ ВСЕХ ⟩ В центре Таллинна прозвучат песни Виктора Цоя
«Пожирающая!»: мать Тимати раскритиковали за неуместное поведение на родах Валентины Ивановой
Платформа «DатаРу Облако» аттестована для работы с государственными данными и информацией повышенной категории
Клинический психолог Юлия Тарибо: психологические последствия удаленной работы и способы их преодоления
Побывавший в космосе объектив «Швабе» стал частью коллекции Политехнического музея
Директор Росгвардии Герой России генерал армии Виктор Золотов принял участие в заседании Национального антитеррористического комитета
Директор Росгвардии Герой России генерал армии Виктор Золотов принял участие в заседании Национального антитеррористического комитета
Процесс сошел с рельсов // Верховный суд определил пересмотреть дело о наезде Kia на трамвай
Абрау Дюрсо, аналитика по компании #ABRD #обзор
"Начинаем привыкать". Бизнес и власти о том, как россиянам жить в эпоху интернет-блэкаутов
В Москве на видео попало, как подростка на электросамокате отбросило под автобус
В Сети появились кадры ДТП с подростками на самокате, которые врезались в столб
Выяснились детали смертельной аварии с участием 16-летних самокатчиков на западе Москвы
Baza: Мотоциклист попал в ДТП в Москве из-за нарушившего ПДД водителя
Почему Трамп захотел быстро встретиться с Путиным, объяснил Хазин
Bloomberg: встреча Путина и Трампа означает победу России
Bloomberg: встреча Путина и Трампа сама по себе представляет победу Москвы
Почему Трамп сказал, что едет в Россию, если встреча назначена в Аляске
Здоровье Бориса Щербакова: обновленные сведения от научно-исследовательского центра имени Склифосовского
Главный врач клиники микрохирургии глаза АйМед Элина Санторо: что делать если лопнул сосуд в глазу
Подмосковный травматолог дал советы по выбору рюкзака для первоклассника
Клинический психолог Юлия Тарибо: психологические последствия удаленной работы и способы их преодоления
«Будет обмен землей»: Трамп поставил Зеленского на место, вызвав панику в Киеве
Политолог: Алиев пересек красную линию и столкнется с ответом Москвы
На пенсии отоспишься. 13 идей для ночного досуга в Москве — от тенниса до парилки
В регионах центральной России росгвардейцы отметили День физкультурника
Соревнования по многоборью кинологов-росгвардейцев завершились в Грозном
Чемпионат по самбо столичного главка Росгвардии завершился в Москве
Лукашенко получил первую золотую монету из белорусского сырья
Собянин рассказал, как проект «Город героев» укрепляет связь времен и поколений
Собянин оценил вклад проектов "Город героев" и "Герой моего района
Собянин рассказал о строительстве нового путепровода на северо-востоке Москвы
Ивлеева предположила, что Трамп увидит метро Москвы и увезет Собянина в США
В Крыму потушили угрожавший двум селам природный пожар
Хватит морщиться: ученые назвали пользу от участившихся московских ливней
Площадь возгорания на горе Куцай достигла 650 тысяч квадратных метров
Что подготовили в павильонах «Музеона» в рамках форума «Москва 2030»
В Сыктывкаре 31 августа состоится масштабный крестный ход по улицам города
Председатель союза китайских предпринимателей Лицюнь высоко оценил качество дорог России
В Подмосковье девушка на моноколесе попала под грузовик
МЧС предупредило жителей столицы грозе с дождем 12 августа
Сотрудниками полиции и Росгвардии задержан гражданин, причастный к поджогу релейного шкафа в Архангельской области
Орловская область планирует войти в число национальных туристических маршрутов с проектом «Бирюзовое кольцо России»
Здание морского речного вокзала в Архангельске будет обновлено к концу 2026 года
Когда достроят больницу скорой помощи и онкодиспансер в Севастополе
Прогноз погоды в Крыму на 10 августа
Прогноз погоды в Крыму на понедельник
Историко-краеведческая выставка «Древности земли крымской»
Саратовский завод РМК поставит резервуары для хранения серной кислоты в Крым
Московские росгвардейцы задержали мужчину, пытавшегося пройти на территорию монастыря в состоянии опьянения
Миллионные долги и разбитые партнерства: судебные баталии Аллы Пугачевой
В Сыктывкаре 31 августа состоится масштабный крестный ход по улицам города