Добавить новость
smi24.net
News in English
Январь
2023

A blood test for cancer shows promise thanks to machine learning

0

A team of researchers at the University of Wisconsin­–Madison has successfully combined genomics with machine learning in the quest to develop accessible tests that allow earlier detection of cancer.

For many types of cancer, early detection can lead to better outcomes for patients. While scientists are developing new blood tests that analyze DNA to aid in earlier detection, these new technologies have limitations, including cost and sensitivity.

In a study published this week in Science Translational Medicine and led by Muhammed Murtaza, professor of surgery at the UW School of Medicine and Public Health, researchers used a machine-learning model to examine blood plasma for DNA fragments from cancer cells. The technique, which uses readily available lab materials, detected cancers at an early stage among most of the samples they studied.

“We’re incredibly excited to discover that early detection and monitoring of multiple cancer types are potentially feasible using such a cost-effective approach,” says Murtaza.

The approach hinges on analyzing fragments of cell-free DNA. Such fragments are commonly found in plasma, which is the liquid portion of blood. The fragments of genetic material typically come from blood cells that die as part of the body’s natural processes, but they can also be shed by cancer cells.

The research team hypothesized that DNA fragments from cancer cells might differ from healthy cell fragments in terms of where the DNA strands break, and what nucleotides — the building blocks of DNA — surround the breaking points.

Using a technique they’ve dubbed GALYFRE (from Genome-wide AnaLYsis of FRagment Ends), the team analyzed cell-free DNA from 521 samples and sequenced data from an additional 2,147 samples from healthy individuals and patients with 11 different cancer types.

From these analyses, they developed a measure reflecting the proportion of cancer-derived DNA molecules present in a sample. They called this information-weighted fraction of aberrant fragments.

They used this measure, along with information on the DNA sequences surrounding fragment breaking points, to develop a machine-learning model that would compare DNA fragments from healthy cells to those from different types of cancer cells.

The model accurately distinguished people with any stage of cancer from healthy individuals 91% of the time. In addition, the model accurately identified samples from patients with stage 1 cancer in 87% of cases, suggesting it holds promise for detecting cancer in early stages.

The information-weighted fraction of aberrant fragments method is “shown suitable to detect changes in tumor burden over time in confounding brain tumors like glioblastoma, which could also offer real-time efficacy assessment of ongoing treatment of this aggressive disease,” says Michael Berens, professor at the Translational Genomics Research Institute’s Brain Tumor Unit and contributing author on the paper.

Murtaza says that while the current results are promising, more studies are needed to refine GALYFRE’s use in different age groups and in patients who have additional medical conditions. The team is also planning larger clinical studies to validate the test for specific cancer types such as pancreatic cancer and breast cancer.

“One direction we are taking is refining GALYFRE to make it even more accurate for some patients who are at risk of developing specific types of cancers. Another aspect we are working on is determining if our approach can be used to monitor treatment response in cancer patients who are receiving chemotherapy.”

“My hope,” Murtaza adds, “is that with additional development, this work will lead to a blood test for cancer detection and monitoring that will be available clinically in the next 2-5 years for at least some conditions, and ultimately be accessible for patients with limited healthcare resources in the U.S. and around the world.”








Лео Канделаки и Анжелика Стубайло сыграют в новую трэвел-игру «Кто куда» на ТНТ

KENGURU GAMES в Звенигороде звенели на всю страну

Лео Канделаки и Анжелика Стубайло посетят Казань в новой трэвел-игре «Кто куда» на ТНТ

Интересные каналы в Telegram. Лучшие каналы в Telegram.


Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

Tourism is increasing over prepandemic levels, overwhelming popular destinations

The Best Story Of Chicago Bulls’ Offseason Just Got A Happy Ending

OpenAI warns that its new ChatGPT Agent has the ability to aid dangerous bioweapon development


Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)

Методы стеганографии становятся популярнее: когда картинка может стать угрозой ИБ

Новая модель Hyundai Elantra уже доступна в России: какие изменения произошли

Зима в Ленинградской области


Bungie promises to fix Destiny 2's new metroid-style morph ball as it makes players sick and glitches out on ultrawide monitors

Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android



Летняя школа Русского дома приняла детей из Карабаха

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Студия Лебедева запустила образовательный проект, в котором заказчики сами создают свой дизайн

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби


Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Лео Канделаки и Анжелика Стубайло сыграют в новую трэвел-игру «Кто куда» на ТНТ

Вкусно, полезно и экзотично: краткий гастрогид по Псковской области

Нам есть чем гордиться: каким будет Национальный центр «Россия» на Краснопресненской набережной


Круизные компании сообщают об изменении маршрутов теплоходов из-за аварии на Городецком гидроузле

Мнение талантов о предстоящем турнире по League of Legends

«СВЯЗАННАЯ ИСТОРИЯ» Керима Аккизова

Синоптик Леус: Погода в Москве теплеет вопреки климатическим расчетам


Теннисистка Мур высказалась о проблемах в антидопинговой системе.

Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP

Рублев вместе с чешской теннисисткой заявился в микст на US Open

«Саша забрал корону». ATP отреагировал на триумф Александра Бублика


Минниханов в Челнах поблагодарил патриарха Кирилла за участие в духовной жизни Татарстана

Орешкин назвал европейские экономики умирающими

Подростковая преступность начала расти в России впервые за несколько лет

«СВЯЗАННАЯ ИСТОРИЯ» Керима Аккизова


Музыкальные новости

В Петербурге требуют заблокировать сайты, продающие липовые билеты в Мариинку

Полина Гагарина открыла официальную часть VK Fest в Москве

Карточка Артиста. Карточка артиста яндекс.

Элджей во время выступления на VK Fest поцеловал свою девушку Anikv: видео Super


Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Студия Лебедева запустила образовательный проект, в котором заказчики сами создают свой дизайн

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

Летняя школа Русского дома приняла детей из Карабаха


Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

Уже не крепкий орешек: как Брюс Уиллис живет с неизлечимой болезнью

Собянин: в Москве работает более 2,3 тысячи шахматных кружков

В Шереметьево начали бесплатно раздавать матрасы ожидающим рейсов


Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest

Сильный ливень заблокировал людей в авто в центре Москвы

25 июля пилотажная группа "Звезда" пролетит над пробками на шоссе под Москвой

Москвичей предупредили о задержках наземного транспорта из-за ливня


Министр юстиции поделился информацией о роли адвокатов в специальной военной операции.

Нам есть чем гордиться: каким будет Национальный центр «Россия» на Краснопресненской набережной

Путин выразил соболезнования семье председателя Верховного суда Подносовой

Путин отметил успехи российских школьников на математической олимпиаде.




«Я на инвалидном кресле, он на «Тесле»: что случилось с блогером Мариш Мариш

После вспышки инфекции на теплоходе «Леонид Красин» начали расследование

Уже не крепкий орешек: как Брюс Уиллис живет с неизлечимой болезнью

Офтальмолог Кирилл Светлаков: секреты здоровых глаз для тех, кто носит контактные линзы


«СТРАНА.ua»: Зеленский раскритиковал ЕС за непредоставление обещанной помощи

В центре Киева митингуют против реформ Зеленского


Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

KENGURU GAMES в Звенигороде звенели на всю страну

В Москве впервые пройдет фестиваль экстремальных видов спорта


Куда Лукашенко хочет пристроить лишних дипломатов

Юрист Трампа Коул рассказал, как пил водку с Лукашенко в Минске

Лукашенко призвал белорусских нефтяников «не раскачиваться, а бурить и бурить»

Посланник Трампа рассказал, как «неформально» договаривался с Лукашенко: после нескольких тостов Минск освободил политзаключенных


Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве — Сергей Собянин

Собянин: Модернизация двух корпусов ГКБ имени Вересаева завершится в этом году

Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве - Сергей Собянин

Собянин рассказал, как город заботится о природе при строительстве метро


Уже 59 орловчан решили побороться за просветительскую награду «Знание. Премия»

Фестиваль «Сады и цветы»: как Москву превращают в городской оазис

Россияне рассказали, по каким критериям выбирают квартиру для покупки в 2025 году

Зарядки для электромобилей «Энергия Москвы» станут платными


Мнение талантов о предстоящем турнире по League of Legends

В Ассоциации операторов микромобильности высказались о проблеме детей на электросамокатах

Парк Юрия Лужкова 19 июля стал площадкой фестиваля The BOWL

«СВЯЗАННАЯ ИСТОРИЯ» Керима Аккизова


Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

В Башкирии ревнивец ранил жену шампуром и сдался полиции

Девочка упала при посадке на теплоход в порту Архангельска


В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

Поезда в Крым и из Крыма следуют с задержками до пяти часов

В Симферополе наградили юных крымчан за отвагу и решительность

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно


Парк Юрия Лужкова 19 июля стал площадкой фестиваля The BOWL

Мнение талантов о предстоящем турнире по League of Legends

С режиссером Юрием Карой простились в Москве

Любовь в сердце и в «Тропикана Парк»














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *