Добавить новость
smi24.net
News in English
Январь
2023

A blood test for cancer shows promise thanks to machine learning

0

A team of researchers at the University of Wisconsin­–Madison has successfully combined genomics with machine learning in the quest to develop accessible tests that allow earlier detection of cancer.

For many types of cancer, early detection can lead to better outcomes for patients. While scientists are developing new blood tests that analyze DNA to aid in earlier detection, these new technologies have limitations, including cost and sensitivity.

In a study published this week in Science Translational Medicine and led by Muhammed Murtaza, professor of surgery at the UW School of Medicine and Public Health, researchers used a machine-learning model to examine blood plasma for DNA fragments from cancer cells. The technique, which uses readily available lab materials, detected cancers at an early stage among most of the samples they studied.

“We’re incredibly excited to discover that early detection and monitoring of multiple cancer types are potentially feasible using such a cost-effective approach,” says Murtaza.

The approach hinges on analyzing fragments of cell-free DNA. Such fragments are commonly found in plasma, which is the liquid portion of blood. The fragments of genetic material typically come from blood cells that die as part of the body’s natural processes, but they can also be shed by cancer cells.

The research team hypothesized that DNA fragments from cancer cells might differ from healthy cell fragments in terms of where the DNA strands break, and what nucleotides — the building blocks of DNA — surround the breaking points.

Using a technique they’ve dubbed GALYFRE (from Genome-wide AnaLYsis of FRagment Ends), the team analyzed cell-free DNA from 521 samples and sequenced data from an additional 2,147 samples from healthy individuals and patients with 11 different cancer types.

From these analyses, they developed a measure reflecting the proportion of cancer-derived DNA molecules present in a sample. They called this information-weighted fraction of aberrant fragments.

They used this measure, along with information on the DNA sequences surrounding fragment breaking points, to develop a machine-learning model that would compare DNA fragments from healthy cells to those from different types of cancer cells.

The model accurately distinguished people with any stage of cancer from healthy individuals 91% of the time. In addition, the model accurately identified samples from patients with stage 1 cancer in 87% of cases, suggesting it holds promise for detecting cancer in early stages.

The information-weighted fraction of aberrant fragments method is “shown suitable to detect changes in tumor burden over time in confounding brain tumors like glioblastoma, which could also offer real-time efficacy assessment of ongoing treatment of this aggressive disease,” says Michael Berens, professor at the Translational Genomics Research Institute’s Brain Tumor Unit and contributing author on the paper.

Murtaza says that while the current results are promising, more studies are needed to refine GALYFRE’s use in different age groups and in patients who have additional medical conditions. The team is also planning larger clinical studies to validate the test for specific cancer types such as pancreatic cancer and breast cancer.

“One direction we are taking is refining GALYFRE to make it even more accurate for some patients who are at risk of developing specific types of cancers. Another aspect we are working on is determining if our approach can be used to monitor treatment response in cancer patients who are receiving chemotherapy.”

“My hope,” Murtaza adds, “is that with additional development, this work will lead to a blood test for cancer detection and monitoring that will be available clinically in the next 2-5 years for at least some conditions, and ultimately be accessible for patients with limited healthcare resources in the U.S. and around the world.”








Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Баскова, Киркорова и Лазарева погнали с экранов: попались на непотребщине

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Модель Анастасия Решетова перенесла вирус с осложнениями


Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch

Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."

La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo


Axenix и RightStep стали партнерами в области комплексной цифровизации промышленных предприятий

Предгрозовое...

Специалисты Нацпроектстроя надвигают путепровод СБВ над путями МЦД-2

Отдых в отеле, джип и частный дом: какие взятки мог получить экс-губернатор Тамбовской области


Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'



«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива


Бодрость духа, грация и пластика: памяти Владимира Высоцкого

Жертва перестройки — почему эта Волга была обречена

ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Οфициaльнο: Ποcлeдний aвиaнοceц Ροccии xοтят οтпpaвить нa мeтaллοлοм

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Синоптики спрогнозировали ясную погоду на выходных в Москве


Медведев пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне

Россиянин Сидоренко выиграл золото Универсиады в настольном теннисе

Винус Уильямс — самая возрастная победительница матча WTA с 2004 года

Сидоренко из России одержал победу и стал чемпионом по настольному теннису на Универсиаде.


Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД

После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам

Сотрудники органов принудительного исполнения обеспечивают безопасность судебных процессов


Музыкальные новости

Менеджер Артиста. Менеджер по работе с артистами.

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

AI Певица. Создание AI Певицы. AI Певец. AI Артист.

Наталья Фриске показала дочь в костюме врача и поведала о своем самочувствии


Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива


В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса

Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)


В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


В сентябре Путину будет представлена обновленная программа строительства кораблей для ВМФ.

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры


Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая

Штамм коронавируса "стратус" захватил 22% всех вирусных заболеваний в Москве

Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это


Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах


Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.


Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Сергей Собянин осмотрел Дом-музей Федора Конюхова


Бурмистров: лисы могут появляться на улицах Москвы в период расселения

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

Москвичи теперь должны платить за зарядку своих электромобилей

Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.


В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург

Ученый Толстых объяснил, что московские ливни вызваны мощным атлантическим циклоном

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам


В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.

Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма

Прогноз погоды в Крыму на 25 июля

Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры


В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург

Как мы в Fix Price автоматизировали создание рекламных видео

Еще одно здание ГБУ «Жилищник» появится во Внукове

Движeниe нa Зaпοpοжьe: pοccийcκиe вοйcκa ɜaшли в Ϲтeпнοгοpcκ














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *