The prophage-encoded transcriptional regulator AppY has pleiotropic effects on E. coli physiology
by Naoual Derdouri, Nicolas Ginet, Yann Denis, Mireille Ansaldi, Aurélia Battesti
Bacterial genome diversity is influenced by prophages, which are viral genomes integrated into the bacterial chromosome. Most prophage genes are silent but those that are expressed can provide unexpected properties to their host. Using as a model
E.
coli K-12 that carries 9 defective prophages in its genome, we aimed at highlighting the impact of genes encoded by prophages on host physiology. We focused our work on AppY, a transcriptional regulator encoded on the DLP12 prophage. By performing RNA-Seq experiments, we showed that AppY production modulates the expression of more than 200 genes. Among them, 11 were identified by ChIP-Seq as direct AppY targets. AppY directly and positively regulates several genes involved in the acid stress response including the master regulator gene
gadE but also
nhaR and
gadY, two genes important for biofilm formation. Moreover, AppY indirectly and negatively impacts bacterial motility by favoring the degradation of FlhDC, the master regulator of the flagella biosynthesis. As a consequence of these regulatory effects, AppY increases acid stress resistance and biofilm formation while also causing a strong defect in motility. Our research shed light on the importance to consider the genetic interactions occurring between prophages and bacteria to fully understand bacterial physiology. It also highlights how a prophage-encoded transcriptional regulator integrates in a complex manner into the host regulatory network and how it benefits its host, allowing it to cope with changing environmental conditions.
Баскова, Киркорова и Лазарева погнали с экранов: попались на непотребщине
В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки
Дети играют, родители отдыхают
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo
Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."
Why Juventus spent 111m this summer for only one new player
Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur
Летний Петербург. Сад--трасформер на Московской площади.
Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты
В Фатеже два человека пострадали в ДТП
В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей
The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game
Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'
Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes
Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country
В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей
Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка
Михаил Ефремов разъехался с женой на фоне новостей о разводе
Трагедия для всей России: наша любимая актриса из "Служебного романа" скончалась на 82-м году жизни
Жители Хакасии подали 80 заявок на Слёт Всемирного фестиваля молодёжи
История СССР в объективе легендарного Дмитрия Бальтерманца
Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности
Группа Аквилон передала государству первые квартиры
Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP
Медведев обыграл У Ибина и вышел в 1/4 финала турнира в Вашингтоне
Винус Уильямс получила wild card на турнир категории WTA 1000 в Цинциннати
Теннисистка Саккари спасла жука во время матча на турнире в США
Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена
В Ростовской области обломки БПЛА привели к задержке 10 пассажирских поездов
Патрушев: НАТО усиливает давление у морских границ России
Группа Аквилон передала государству первые квартиры
Музыкальные новости
Баста и Шура снимаются в сериале «Вирус попсы»
Певец Андрей Макаревич признался, что приехал в Юрмалу на фестиваль Вайкуле
«С детства было ясно, что растет большой артист»: мать Тимати высказалась о популярности сына
Продюсер рассказал, почему заменил Shaman в опере «Князь Владимир»
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса
Будь собой, а не "звездой": "Europarty" от White Queen
Инсайдер Карпов: "Спартак" предложил "Динамо" Мх за Пальцева 250 млн рублей
Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье
В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)
Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы
На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено
Поезда не будут ходить на участке Сокольнической линии метро с 26 по 28 июля
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"
Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры
В сентябре Путину будет представлена обновленная программа строительства кораблей для ВМФ.
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая
Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это
Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире
Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много
Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне
Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию
Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.
Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве
Собянин поддержал проведение конкурса «Лучший книжный магазин Москвы»
Сергей Собянин. Главное за день
Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова
Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике
6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин
Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала
Детеныш краснокнижной боливийской обезьяны появился на свет в Московском зоопарке
Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.
Патрушев: НАТО усиливает давление у морских границ России
Врач Щетинина: натуральные соки могут навредить здоровью пожилых
Как мы в Fix Price автоматизировали создание рекламных видео
В Ростовской области обломки БПЛА привели к задержке 10 пассажирских поездов
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки
В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры
В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями
"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму
Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма
Кто прошёл в финал «Нашей новой музыки»: фото участников
Патрушев: НАТО усиливает давление у морских границ России
Россия готова решительно парировать военные угрозы на море, заявил Патрушев
История СССР в объективе легендарного Дмитрия Бальтерманца