The prophage-encoded transcriptional regulator AppY has pleiotropic effects on E. coli physiology
by Naoual Derdouri, Nicolas Ginet, Yann Denis, Mireille Ansaldi, Aurélia Battesti
Bacterial genome diversity is influenced by prophages, which are viral genomes integrated into the bacterial chromosome. Most prophage genes are silent but those that are expressed can provide unexpected properties to their host. Using as a model
E.
coli K-12 that carries 9 defective prophages in its genome, we aimed at highlighting the impact of genes encoded by prophages on host physiology. We focused our work on AppY, a transcriptional regulator encoded on the DLP12 prophage. By performing RNA-Seq experiments, we showed that AppY production modulates the expression of more than 200 genes. Among them, 11 were identified by ChIP-Seq as direct AppY targets. AppY directly and positively regulates several genes involved in the acid stress response including the master regulator gene
gadE but also
nhaR and
gadY, two genes important for biofilm formation. Moreover, AppY indirectly and negatively impacts bacterial motility by favoring the degradation of FlhDC, the master regulator of the flagella biosynthesis. As a consequence of these regulatory effects, AppY increases acid stress resistance and biofilm formation while also causing a strong defect in motility. Our research shed light on the importance to consider the genetic interactions occurring between prophages and bacteria to fully understand bacterial physiology. It also highlights how a prophage-encoded transcriptional regulator integrates in a complex manner into the host regulatory network and how it benefits its host, allowing it to cope with changing environmental conditions.
От «Лебединого озера» до «Дон Кихота»: Relax FM приглашает на балет
Сеть клиник «Будь Здоров» открыла первый травмпункт сети на базе клиники на Сретенке
Желдорреммаш подводит итоги работы за первое полугодие 2025 года
UNOde50 представил коллекцию осень-зима 2025/26 (FW-2025/26): украшения как путь к себе
Dear Abby: Our son was clean and fit until Emily came along
Kolo Muani: Juventus prepare new offer but face Man United and Chelsea threat
Weah’s agent: One Juventus director ‘is creating problems’
Today in History: July 28, US Army airplane crashes into Empire State Building
Сунул нос не в своё дело: серийного нюхателя жоп снова поймали в Калифорнии
Анекдоты недели и украденное лето
От «Лебединого озера» до «Дон Кихота»: Relax FM приглашает на балет
Как хакеры обманывают авиацию сегодня
Five Nights at Freddy's 2 movie gets its first full trailer for Comic-Con, promising even more animatronic terror
Fretless — The Wrath of Riffson — музыка спасёт мир. Рецензия
Bloody fighting game Invincible VS gets its most brutal character yet in Comic-Con trailer
Quarantine Zone creator reveals 3 reasons the zombie sim went viral on TikTok
Клиника гнатологии – лечение ВНЧС и восстановление прикуса
От «Лебединого озера» до «Дон Кихота»: Relax FM приглашает на балет
Чемпионат по военно-спортивному многоборью среди росгвардейцев завершился в Грозном
Александр Михайлов (GSOC): «Безопасность IT-экосистемы — это зона нулевого доверия к подрядчикам»
Александр Михайлов (GSOC): «Безопасность IT-экосистемы — это зона нулевого доверия к подрядчикам»
Где живут и на чем ездят самые аварийные водители России?
СК сообщил о возбуждении уголовного дела из-за обвала скалы в Кисловодске
Лео Канделаки и Анжелика Стубайло сыграют в новую трэвел-игру «Кто куда» на ТНТ
Путин: модернизация Военно-морского флота усилит защиту интересов России
Путин указал на важность ипотеки для граждан без дополнительных плат по договору
Детёныш редкого кенгуру валлаби появился на свет в Московском зоопарке
"Аэрофлот" сообщил о возобновлении нормальной работы по расписанию
Кудерметова пробилась во второй раунд турнира в Монреале.
Чемпион Универсиады по настольному теннису Сидоренко будет выступать за японский клуб
Калина потерпела третье поражение в финале турнира WTA за свою карьеру.
Теннисистка Калинская после победы в США дала послематчевое интервью с собакой
Августовский урожай. Сезонные ягоды и фрукты, которые стоит купить сейчас
В Тулу привезли походную икону с главной святыней Новодевичьего монастыря
Детёныш редкого кенгуру валлаби появился на свет в Московском зоопарке
"Аэрофлот" сообщил о возобновлении нормальной работы по расписанию
Музыкальные новости
Как начать петь. Как начать петь песни. Как начать петь с нуля
Утро Майи Плисецкой начиналось с кофе — и со строжайшей дисциплины: как легендарная балерина поддерживала порядок
Сергей Шнуров показал идеальную Россию с помощью Костромы
СМИ: Оззи Осборна похоронят в Бирмингеме 30 июля
Клиника гнатологии – лечение ВНЧС и восстановление прикуса
Чемпионат по военно-спортивному многоборью среди росгвардейцев завершился в Грозном
От «Лебединого озера» до «Дон Кихота»: Relax FM приглашает на балет
Александр Михайлов (GSOC): «Безопасность IT-экосистемы — это зона нулевого доверия к подрядчикам»
Сбер сохранил прогноз по рентабельности капитала на 2025 г. свыше 22%
«Спартак» разгромно проиграл «Балтике» после двух удалений
Песков сообщил об отсутствии переговоров с США по поводу продления ДСНВ
ЦБ готовится к новому решению: как изменится ключевая ставка и что ждет рынок недвижимости
Сотрудники ОМОН Росгвардии помогли пострадавшему в ДТП на МКАД
В Москве 2 будет ограничено движение автомобилей
Где живут и на чем ездят самые аварийные водители России?
Культовый BAW 212 уже в России
Путин поделился достижениями России в области технологий искусственного интеллекта.
Путин сделал шутку о системе "Оплата с помощью улыбки".
Греф представил Путину отчет о деятельности Сбербанка.
Володин сообщил о интеграции парламента в стратегию развития России под руководством Путина.
Новый штамм COVID-19 переносится как легкая форма ОРВИ
Депутата ЗакСа Ленобласти Ивана Апостолевского задержали за пост с Навальным*
Врач-косметолог Зухра Балакеримова: как замедлить старение кожи
Клиника гнатологии – лечение ВНЧС и восстановление прикуса
Медицинские справки для школьников в центре ВИТА
Медицинские справки для школьников в центре ВИТА
Чтобы убрать Зеленского, США достаточно показать ему одну папку: вот почему Киев упал в ноги Трампу
Кто заставил Зеленского предложить России новый раунд переговоров: В Британии показали пальцем
В День парашютиста героем рубрики «Знай наших» стал сотрудник вневедомственной охраны столичного главка Росгвардии младший лейтенант полиции Александр С.
Чемпионат по военно-спортивному многоборью среди росгвардейцев завершился в Грозном
Чемпионат по военно-спортивному многоборью среди росгвардейцев завершился в Грозном
«Краснодар» и московское «Динамо» проведут сегодня первые матчи в Кубке России
Лукашенко сообщил о телефонном разговоре с Путиным
В Минске готовы активизировать сотрудничество с Эфиопией
Лукашенко взял на контроль ситуацию с уничтожением БПЛА над Минском
Собянин рассказал, как строят станцию «Достоевская» Кольцевой линии метро
Собянин: Участие москвичей в жизни города — ключ ко всем позитивным изменениям
Станция "Достоевская" Кольцевой линии метро готова на четверть - Собянин
Собянин рассказал о тестировании уникальной ИИ-системы для диагностики инсульта
Число пострадавших от непогоды автомобилей растет
Почему технологии ПВВК безопасны и эффективны, химия и экология воды по мнению Алексея Горшкова
В Бузулукском бору в эти дни работает смена проекта «Заповедное дело РГО»
В Ростокине расскажут о млекопитающих Москвы
Глава Кисловодска: Под завалами после обрушения грунта может оставаться человек
Обрушение в санатории "Москва" в Кисловодске: пострадали двое отдыхающих
В Тулу привезли походную икону с главной святыней Новодевичьего монастыря
Детёныш редкого кенгуру валлаби появился на свет в Московском зоопарке
В Архангельске представили киноальманах «Север, я люблю тебя!» по произведениям современных писателей
В Архангельске с 29 июля перекрывается движение по участку набережной Северной Двины
Прогноз погоды в Крыму на 27 июля
В Крыму из-за дыма от пожара столкнулись девять автомобилей
Сколько пассажиров прибывают в Крым летом на поездах ежедневно
В Севастополе пройдет масштабная выставка картин Александра Дейнеки
Двое туристов из Тольятти пострадали в Кисловодске из-за обвала грунта
Августовский урожай. Сезонные ягоды и фрукты, которые стоит купить сейчас
"Аэрофлот" сообщил о возобновлении нормальной работы по расписанию
Путин указал на важность ипотеки для граждан без дополнительных плат по договору