Добавить новость
smi24.net
News in English
Июль
2023

Improve the model of disease subtype heterogeneity by leveraging external summary data

0

by Sheng Fu, Mark P. Purdue, Han Zhang, Jing Qin, Lei Song, Sonja I. Berndt, Kai Yu

Researchers are often interested in understanding the disease subtype heterogeneity by testing whether a risk exposure has the same level of effect on different disease subtypes. The polytomous logistic regression (PLR) model provides a flexible tool for such an evaluation. Disease subtype heterogeneity can also be investigated with a case-only study that uses a case-case comparison procedure to directly assess the difference between risk effects on two disease subtypes. Motivated by a large consortium project on the genetic basis of non-Hodgkin lymphoma (NHL) subtypes, we develop PolyGIM, a procedure to fit the PLR model by integrating individual-level data with summary data extracted from multiple studies under different designs. The summary data consist of coefficient estimates from working logistic regression models established by external studies. Examples of the working model include the case-case comparison model and the case-control comparison model, which compares the control group with a subtype group or a broad disease group formed by merging several subtypes. PolyGIM efficiently evaluates risk effects and provides a powerful test for disease subtype heterogeneity in situations when only summary data, instead of individual-level data, is available from external studies due to various informatics and privacy constraints. We investigate the theoretic properties of PolyGIM and use simulation studies to demonstrate its advantages. Using data from eight genome-wide association studies within the NHL consortium, we apply it to study the effect of the polygenic risk score defined by a lymphoid malignancy on the risks of four NHL subtypes. These results show that PolyGIM can be a valuable tool for pooling data from multiple sources for a more coherent evaluation of disease subtype heterogeneity.







Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

По итогам первого полугодия 2025 года предприятия «ЛокоТех-Сервис» отремонтировали более 1 тыс. секций локомотивов сверх плана и повысили качество сервисного обслуживания

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."

La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo

Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur


Первый маршрут теплохода-ресторана открылся из Петербурга в Кронштадт

Axenix и RightStep стали партнерами в области комплексной цифровизации промышленных предприятий

Специалисты Нацпроектстроя надвигают путепровод СБВ над путями МЦД-2

Monochamus scutellatus


Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country



Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива


ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты


Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена

После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам

В Самарской области за полгода открыто 410 вакансий для сисадминов, что на 22% меньше, чем годом ранее

В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург


Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP

Винус Уильямс: Если Серена вернется, она даст вам знать

Болбой раздавил спасенного теннисисткой Cаккари жука на турнире WTA-500 в США

Фриц пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне.


Еще одно здание ГБУ «Жилищник» появится во Внукове

Солнечная погода и до 29 градусов тепла ожидаются в Москве 25 июля

Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Работа над качеством: цифровой аудитор внедрен на горячей линии московских судов


Музыкальные новости

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса

«Чем твои генералы лучше студентов?»: как Владимир Высоцкий выступал в Калинине

«Стал таким, каким должен быть мужчина в 45»: Баста об ошибках молодости


«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»


В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники

В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры

В сентябре Путину будет представлена обновленная программа строительства кораблей для ВМФ.

"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"


Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая



Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек


Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне


Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова

Сергей Собянин осмотрел Дом-музей Федора Конюхова


В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

Бурмистров: лисы могут появляться на улицах Москвы в период расселения


В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена

В Самарской области за полгода открыто 410 вакансий для сисадминов, что на 22% меньше, чем годом ранее


Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.

70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский


Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры

Прогноз погоды в Крыму на 25 июля

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма


Солнечная погода и до 29 градусов тепла ожидаются в Москве 25 июля

В Самарской области за полгода открыто 410 вакансий для сисадминов, что на 22% меньше, чем годом ранее

Еще одно здание ГБУ «Жилищник» появится во Внукове

Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *