Добавить новость
smi24.net
News in English
Июль
2023

Improve the model of disease subtype heterogeneity by leveraging external summary data

0

by Sheng Fu, Mark P. Purdue, Han Zhang, Jing Qin, Lei Song, Sonja I. Berndt, Kai Yu

Researchers are often interested in understanding the disease subtype heterogeneity by testing whether a risk exposure has the same level of effect on different disease subtypes. The polytomous logistic regression (PLR) model provides a flexible tool for such an evaluation. Disease subtype heterogeneity can also be investigated with a case-only study that uses a case-case comparison procedure to directly assess the difference between risk effects on two disease subtypes. Motivated by a large consortium project on the genetic basis of non-Hodgkin lymphoma (NHL) subtypes, we develop PolyGIM, a procedure to fit the PLR model by integrating individual-level data with summary data extracted from multiple studies under different designs. The summary data consist of coefficient estimates from working logistic regression models established by external studies. Examples of the working model include the case-case comparison model and the case-control comparison model, which compares the control group with a subtype group or a broad disease group formed by merging several subtypes. PolyGIM efficiently evaluates risk effects and provides a powerful test for disease subtype heterogeneity in situations when only summary data, instead of individual-level data, is available from external studies due to various informatics and privacy constraints. We investigate the theoretic properties of PolyGIM and use simulation studies to demonstrate its advantages. Using data from eight genome-wide association studies within the NHL consortium, we apply it to study the effect of the polygenic risk score defined by a lymphoid malignancy on the risks of four NHL subtypes. These results show that PolyGIM can be a valuable tool for pooling data from multiple sources for a more coherent evaluation of disease subtype heterogeneity.







Делегация «ЛокоТех» посетила финал II чемпионата профессионалов ОАО «РЖД» в Екатеринбурге

«Это лучшее, что я видела за последнее время». «Тату» вернулись и уже дают концерты. Почему за ними следит вся страна?

Любовь в сердце и в «Тропикана Парк»

Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)


La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo

Félix Auger-Aliassime

Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."


Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)

Свято Боголюбский Женский Монастырь

В Челябинске арестован председатель правления банка "Снежинский"

Какие зарплаты нужны для получения льготного автокредита в 2025 году


Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'



Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД

Врач Щетинина: натуральные соки могут навредить здоровью пожилых

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»


Группа Аквилон передала государству первые квартиры

Сотрудники органов принудительного исполнения обеспечивают безопасность судебных процессов

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля

«Спартак» и «Балтика» забьют друг другу. «Спартак» — «Балтика»: прогноз и ставка


Медведев победил У Ибина и вышел в четвертьфинал турнира ATP в Вашингтоне

Винус Уильямс: Если Серена вернется, она даст вам знать

Болбой раздавил спасенного теннисисткой Cаккари жука на турнире WTA-500 в США

Потапова не прошла во второй раунд турнира в Вашингтоне.


Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»

Группа Аквилон передала государству первые квартиры

Математика Савватеева возмутило заявление о "лишних" учителях

Ученый Толстых объяснил, что московские ливни вызваны мощным атлантическим циклоном


Музыкальные новости

Скандальный Сергей Шнуров неожиданно снял стильный путеводитель по Костроме

Баста, Слава и Шура снимутся в новом документальном сериале «Вирус попсы»

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса

Sky News: умерший Осборн с 2019 года страдал от травмы позвоночника


«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Стратегическое партнерство России и Узбекистана укрепляет газохимическую отрасль обеих стран

Акция «Каникулы с Росгвардией» продолжается в Чеченской Республике

Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса


В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

На международном ралли «Шелковый путь – 2025» представили новое моторное масло для мотоциклистов

Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы


Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры


Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая

В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек

Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России


Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского 

Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом

Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию


Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Собянин поддержал проведение конкурса «Лучший книжный магазин Москвы»

Сергей Собянин. Главное за день


Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.

Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала

Детеныш краснокнижной боливийской обезьяны появился на свет в Московском зоопарке

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин


Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка

Сотрудники органов принудительного исполнения обеспечивают безопасность судебных процессов

Группа Аквилон передала государству первые квартиры

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля


Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно

Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями


«Спартак» и «Балтика» забьют друг другу. «Спартак» — «Балтика»: прогноз и ставка

Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка

Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Жители Хакасии подали 80 заявок на Слёт Всемирного фестиваля молодёжи














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *