Добавить новость
smi24.net
News in English
Июль
2023

Improve the model of disease subtype heterogeneity by leveraging external summary data

0

by Sheng Fu, Mark P. Purdue, Han Zhang, Jing Qin, Lei Song, Sonja I. Berndt, Kai Yu

Researchers are often interested in understanding the disease subtype heterogeneity by testing whether a risk exposure has the same level of effect on different disease subtypes. The polytomous logistic regression (PLR) model provides a flexible tool for such an evaluation. Disease subtype heterogeneity can also be investigated with a case-only study that uses a case-case comparison procedure to directly assess the difference between risk effects on two disease subtypes. Motivated by a large consortium project on the genetic basis of non-Hodgkin lymphoma (NHL) subtypes, we develop PolyGIM, a procedure to fit the PLR model by integrating individual-level data with summary data extracted from multiple studies under different designs. The summary data consist of coefficient estimates from working logistic regression models established by external studies. Examples of the working model include the case-case comparison model and the case-control comparison model, which compares the control group with a subtype group or a broad disease group formed by merging several subtypes. PolyGIM efficiently evaluates risk effects and provides a powerful test for disease subtype heterogeneity in situations when only summary data, instead of individual-level data, is available from external studies due to various informatics and privacy constraints. We investigate the theoretic properties of PolyGIM and use simulation studies to demonstrate its advantages. Using data from eight genome-wide association studies within the NHL consortium, we apply it to study the effect of the polygenic risk score defined by a lymphoid malignancy on the risks of four NHL subtypes. These results show that PolyGIM can be a valuable tool for pooling data from multiple sources for a more coherent evaluation of disease subtype heterogeneity.







На банкет – в Fish Point Family Resort

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

«Ужас, который я пережила, никому не пожелаю!»  Алёна Блин взяла в заложники ловца в новой серии «Погони» на ТНТ

В России обнаружено более 100 случаев заболевания новым штаммом COVID-19


La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo

Madeline Brewer Marries Jack Thompson-Roylance in England!

Juventus and Roma weigh up McKennie & Cristante swap

Stanford dropout Sam Altman says college is ‘not working great’ for most people—and predicts major change in the next 18 years


Свято Боголюбский Женский Монастырь

В Курской области прокурор требует компенсацию для рабочего, придавленного погрузчиком

HRlink упростил контроль за сроками подписания кадровых документов

Снижены цены на самый дорогой кроссовер Chery в России


Первый трейлер Battlefield 6

Quarantine Zone creator reveals 3 reasons the zombie sim went viral on TikTok

Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

Ninja Party можно предзаказать в мобильных маркетах с релизом в конце июля



В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры

Уникальная возможность пройти эстетические процедуры с большими скидками

На банкет – в Fish Point Family Resort

«Спартак» разгромно проиграл «Балтике» после двух удалений


В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры

Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы

Ана Каспарян поднимает вопросы Геноцида армян, этнических чисток в Арцахе и роли Израиля в конфликте — в откровенном интервью с Такером Карлсоном. ВИДЕО

Елена Игоревна Вселенная — писатель, публицист, автор масштабного многотомного проекта «Наследие России»


Подросток расстрелял из травмата охранника железнодорожной станции в Москве

МВД: в Москве за стрельбу из пневматики на ж/д станции задержали подростка

Тело мужчины извлекли из-под завалов дома в Саратове после взрыва газа

Как найти необычные и нестандартные места для отдыха по всей России — инструкция для искателей приключений


Сидоренко из России одержал победу и стал чемпионом по настольному теннису на Универсиаде.

Теннисистка Калинская после победы в США дала послематчевое интервью с собакой

«Краснодар» — «Локо», UFC и матч Калинской: что посмотреть сегодня

Боузкова одержала победу на теннисном турнире в Праге


Медведев призвал Африку бороться с неоколониализмом

Тело мужчины извлекли из-под завалов дома в Саратове после взрыва газа

В Геленджике скончался 104-летний ветеран ВОВ Иван Курбаков

Россия заработает триллион долларов, а Европа столкнется с новой «чумой»: неожиданные последствия аномального лета 2025


Музыкальные новости

Дочь Успенской впервые показала возлюбленного — интимная обстановка не оставила сомнений

Распродавал дома оставил миллионный долг — что достанется родственникам Оззи Осборна и почему он избавлялся от недвижимости в США

Концерт проекта «Уличные музыканты» состоялся в ступинском парке

Кажетта Ахметжанова: 5 камней для усиления женской энергии


Уникальная возможность пройти эстетические процедуры с большими скидками

«Спартак» разгромно проиграл «Балтике» после двух удалений

Московская область выиграла первый командный чемпионат России по гольфу

В Подмосковье самовольные захватчики земли лишаются дач


Fix Price подготовил всё необходимое к 1 сентября

Росгвардия и МЧС провели совместное учение в Москве (видео)

"Спартак" потерпел сокрушительное поражение от "Балтики" в поединке РПЛ

«Спартак» даст бой «Родине»? «Родина» Москва — «Спартак» Кострома: прогноз и ставка


В Подмосковье в аварии погибли два водителя и ребенок.

"КАМАЗ" одержал выездную победу над "Волгой" в матче Первой лиги.

Подмосковные власти ужесточили контроль за платными дорогами

В центре Москвы крупная авария парализовала движение автомобилей


Почтовая карточка в честь основателя авиации внутренних войск

«Личная боль Путина, а им всё равно»: Военный не сдержался после выходки в Москве. Капитан тремя словами подписал себе «приговор»


Профессор Баранова рассказала, кому опасен новый штамм коронавируса



Максим Ликсутов: Тренд на здоровье: московские ...

"Осторожен за свое здоровье": Станкович высказался о усталости после игры с "Балтикой".

Ликсутов: в Москве выросли объем и ассортимент производства здорового питания

Ликсутов: в Москве увеличивают объем выпуска и ассортимент продуктов для здорового питания


Киев — часть России. Официально: О чём забыли Зеленский и Алиев, сговорившись о "деоккупации"

Почему Израилю можно ВСЁ: Аннексия Палестины и молчание мира

Турция заявила о договоренности по возможной встрече Путина и Зеленского


Ni Mash: пловец из Москвы умер во время заплыва на Волге в Нижнем Новгороде

Пловец из Москвы погиб во время заплыва на Волге

«Спартак» разгромно проиграл «Балтике» после двух удалений

ФК «Ростов» проиграл московским футболистам ФК «Динамо» со счётом 1:0



Собянин: Строительство детского сада в Очаково-Матвеевском завершится в 2026

Собянин: Москвичи победили на Международной олимпиаде по биологии в Филиппинах

Собянин рассказал, каким будет новый детский сад в Очаково-Матвеевском

Сергей Собянин. Главное за день


Катар предупредил Европу о возможности прекращения поставок газа.

Греция обратилась к Евросоюзу с просьбой предоставить шесть самолетов для борьбы с лесными пожарами.

"Зеленая партия" в Тюрингии все чаще дистанцируется от политической активности.

В стране, любимой российскими туристами, срочно установили новые правила.


Тело мужчины извлекли из-под завалов дома в Саратове после взрыва газа

МВД: в Москве за стрельбу из пневматики на ж/д станции задержали подростка

Ана Каспарян поднимает вопросы Геноцида армян, этнических чисток в Арцахе и роли Израиля в конфликте — в откровенном интервью с Такером Карлсоном. ВИДЕО

«Динамо» победило «Ростов» в первом матче под руководством Карпина


В музее-заповеднике «Архангельское» пройдут «Jazzовые сезоны»

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.


К парню с костылем подошли трое с требованием уступить. Он был готов, но заступилась бабушка по соседству

Прогноз погоды в Крыму на 26 июля

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

В Севастополе спасли двух охотниц за селфи на Кадыковском карьере


Медведев призвал Африку бороться с неоколониализмом

На проект Ростовского трамвая в 2025 году планируют выделить 9,5 млрд рублей

Израиль вновь начнет воздушную доставку гуманитарной помощи в сектор Газа.

"Каковы истинные интеллектуальные способности России?" — откровения бывшего аналитика ЦРУ.














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *