Добавить новость
smi24.net
News in English
Ноябрь
2023

Time-optimized protein NMR assignment with an integrative deep learning approach using AlphaFold and chemical shift prediction | Science Advances

0

Abstract

Chemical shift assignment is vital for nuclear magnetic resonance (NMR)–based studies of protein structures, dynamics, and interactions, providing crucial atomic-level insight. However, obtaining chemical shift assignments is labor intensive and requires extensive measurement time. To address this limitation, we previously proposed ARTINA, a deep learning method for automatic assignment of two-dimensional (2D)–4D NMR spectra. Here, we present an integrative approach that combines ARTINA with AlphaFold and UCBShift, enabling chemical shift assignment with reduced experimental data, increased accuracy, and enhanced robustness for larger systems, as presented in a comprehensive study with more than 5000 automated assignment calculations on 89 proteins. We demonstrate that five 3D spectra yield more accurate assignments (92.59%) than pure ARTINA runs using all experimentally available NMR data (on average 10 3D spectra per protein, 91.37%), considerably reducing the required measurement time. We also showcase automated assignments of only 15 N-labeled samples, and report improved assignment accuracy in larger synthetic systems of up to 500 residues.







Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива


Madeline Brewer Marries Jack Thompson-Roylance in England!

Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."


«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры

Navicon представляет комплексную систему для интегрированного управления данными

Дивеево ..


Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country

Первый трейлер Battlefield 6

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'



В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы


Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка


Увοлeн Γуcмaн, οпοɜοpивший Ροccию. Дaдут инοaгeнтa или пοвыcят?

Еще одно здание ГБУ «Жилищник» появится во Внукове

Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах

В Главном управлении ФССП России по Московской области состоялось заседание коллегии


Винус Уильямс: Если Серена вернется, она даст вам знать

Елена Рыбакина вызвала восхищение на старте турнира в Вашингтоне. Видео

Теннисистка Калинская вышла в четвертьфинал турнира WTA 500 в Вашингтоне

Медведев обыграл У Ибина и вышел в 1/4 финала турнира в Вашингтоне


Обломки сбитых дронов повредили контактную сеть на станциях в двух регионах РФ

Члены семьи Евгения Гинера могли потерять более 1 млрд в финансовой пирамиде

Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка

Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах


Музыкальные новости

Оззи Осборн скончался в возрасте 76 лет после продолжительной болезни

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Кабинет Артиста. Яндекс кабинет артиста.

Баста и Шура снимаются в сериале «Вирус попсы»


В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры


"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом

Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье

Okko и ТНТ выпустят драмеди про трёх сестёр «Хай, систерс»

Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest


В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


В сентябре Путину будет представлена обновленная программа строительства кораблей для ВМФ.

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры

"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем


Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая

Штамм коронавируса "стратус" захватил 22% всех вирусных заболеваний в Москве

Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это



"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве


Сергей Собянин осмотрел Дом-музей Федора Конюхова

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом

Сергей Собянин. Главное за день


В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

Бурмистров: лисы могут появляться на улицах Москвы в период расселения

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.


Патрушев: Британия пыталась провокацией на Балтике сорвать переговоры РФ и США

Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка

Пенсионерам с 26 июля поступит на счет разовая выплата с четырьмя нулями

Члены семьи Евгения Гинера могли потерять более 1 млрд в финансовой пирамиде


Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


В центре Балаклавы изменят дорожное движение – причины и сроки

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

Прогноз погоды в Крыму на 25 июля

Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры


Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

Трагедия для всей России: наша любимая актриса из "Служебного романа" скончалась на 82-м году жизни

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *