A multiscale model of the role of microenvironmental factors in cell segregation and heterogeneity in breast cancer development
by J. Roberto Romero-Arias, Carlos A. González-Castro, Guillermo Ramírez-Santiago
We analyzed a quantitative multiscale model that describes the epigenetic dynamics during the growth and evolution of an avascular tumor. A gene regulatory network (GRN) formed by a set of ten genes that are believed to play an important role in breast cancer development was kinetically coupled to the microenvironmental agents: glucose, estrogens, and oxygen. The dynamics of spontaneous mutations was described by a Yule-Furry master equation whose solution represents the probability that a given cell in the tissue undergoes a certain number of mutations at a given time. We assumed that the mutation rate is modified by a spatial gradient of nutrients. The tumor mass was simulated by means of cellular automata supplemented with a set of reaction diffusion equations that described the transport of microenvironmental agents. By analyzing the epigenetic state space described by the GRN dynamics, we found three attractors that were identified with cellular epigenetic states: normal, precancer and cancer. For two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) tumors we calculated the spatial distribution of the following quantities: (i) number of mutations, (ii) mutation of each gene and, (iii) phenotypes. Using estrogen as the principal microenvironmental agent that regulates cells proliferation process, we obtained tumor shapes for different values of estrogen consumption and supply rates. It was found that he majority of mutations occurred in cells that were located close to the 2D tumor perimeter or close to the 3D tumor surface. Also, it was found that the occurrence of different phenotypes in the tumor are controlled by estrogen concentration levels since they can change the individual cell threshold and gene expression levels. All results were consistently observed for 2D and 3D tumors.
Читайте также:
Вчера 22:00
Вчера 22:00
Вчера 22:00
Вчера 22:06
Делегация «ЛокоТех» посетила финал II чемпионата профессионалов ОАО «РЖД» в Екатеринбурге
Баскова, Киркорова и Лазарева погнали с экранов: попались на непотребщине
VZLET.MEDIA: 25 лет успешного SEO-продвижения в эпоху искусственного интеллекта
Дети играют, родители отдыхают
La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo
Why Juventus spent 111m this summer for only one new player
Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."
В Челябинске арестован председатель правления банка "Снежинский"
Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)
Продукты линейки СУБД ЛИНТЕР совместимы с ОС «АльтерОС»
В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки
Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'
Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country
'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'
Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
Трое российских бойцов две недели ползли к своим позициям
Chef's table и новое пространство ресторана «Интеллигенция»
ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей
Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты
Ефимов: за лето к переселению по реновации приступили 10 тыс. москвичей
Клуб Медиалиги «Амкал» предлагал Овечкину сыграть в Кубке России по футболу
Суд арестовал продававшего сведения каналу Baza полицейского из Белгорода
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Соболенко сохраняет первое место в чемпионской гонке WTA.
Болбой раздавил спасенного теннисисткой Cаккари жука на турнире WTA-500 в США
Медведев обыграл У Ибина и вышел в 1/4 финала турнира в Вашингтоне
Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP
Суд над московской ячейкой «Фалуньгун»*: как опасная китайская секта попала в РФ
Клуб Медиалиги «Амкал» предлагал Овечкину сыграть в Кубке России по футболу
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Суд арестовал продававшего сведения каналу Baza полицейского из Белгорода
Музыкальные новости
Баста и Шура снимаются в сериале «Вирус попсы»
На концерт классической музыки «Мне дорог Бах…» приглашают псковичей
Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса
Продюсер рассказал, почему заменил Shaman в опере «Князь Владимир»
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Путин прибыл на прощание с председателем Верховного суда Подносовой
Будь собой, а не "звездой": "Europarty" от White Queen
Инсайдер Карпов: "Спартак" предложил "Динамо" Мх за Пальцева 250 млн рублей
Лео Канделаки и Анжелика Стубайло посетят Казань в новой трэвел-игре «Кто куда» на ТНТ
В Подмосковье на видео попало, как школьник на питбайке разбился в жестком ДТП
Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы
В Москве на видео попало, как самокатчица влетела в авто с правоохранителями
В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)
У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем
Путин отметил успех российских школьников на олимпиаде по физике.
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса
Обнаружен новый штамм коронавируса: он очень заразный и забирает голос
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России
В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского
«Затрудняет путь в ЕС»: Урсула ждёт от Киева разъяснений по поводу ограничения полномочий НАБУ
Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире
Делегация «ЛокоТех» посетила финал II чемпионата профессионалов ОАО «РЖД» в Екатеринбурге
"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Назначены судейские бригады на матчи 2-ого тура МИР РПЛ
Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве
Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию
Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.
Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне
Сергей Собянин. Главное за день
Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова
Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике
Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом
Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала
6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин
В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России
Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.
Ефимов: за лето к переселению по реновации приступили 10 тыс. москвичей
Суд Москвы арестовал челябинского министра имущества Белоусова
По речке в сутки. Ливни обрушатся на Москву с 4 августа
Суд арестовал продававшего сведения каналу Baza полицейского из Белгорода
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома
Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области
"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму
Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно
Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма
У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем
Суд Москвы арестовал челябинского министра имущества Белоусова
Путин обсудил технологию, способную изменить будущее военно-морского флота.
МВД разъясняет, как трудовым мигрантам действовать при изменении данных в паспорте.