Добавить новость
smi24.net
News in English
Ноябрь
2023

IDP-LM: Prediction of protein intrinsic disorder and disorder functions based on language models

0

by Yihe Pang, Bin Liu

Intrinsically disordered proteins (IDPs) and regions (IDRs) are a class of functionally important proteins and regions that lack stable three-dimensional structures under the native physiologic conditions. They participate in critical biological processes and thus are associated with the pathogenesis of many severe human diseases. Identifying the IDPs/IDRs and their functions will be helpful for a comprehensive understanding of protein structures and functions, and inform studies of rational drug design. Over the past decades, the exponential growth in the number of proteins with sequence information has deepened the gap between uncharacterized and annotated disordered sequences. Protein language models have recently demonstrated their powerful abilities to capture complex structural and functional information from the enormous quantity of unlabelled protein sequences, providing opportunities to apply protein language models to uncover the intrinsic disorders and their biological properties from the amino acid sequences. In this study, we proposed a computational predictor called IDP-LM for predicting intrinsic disorder and disorder functions by leveraging the pre-trained protein language models. IDP-LM takes the embeddings extracted from three pre-trained protein language models as the exclusive inputs, including ProtBERT, ProtT5 and a disorder specific language model (IDP-BERT). The ablation analysis shown that the IDP-BERT provided fine-grained feature representations of disorder, and the combination of three language models is the key to the performance improvement of IDP-LM. The evaluation results on independent test datasets demonstrated that the IDP-LM provided high-quality prediction results for intrinsic disorder and four common disordered functions.







Состоялось открытие фотовыставки «Особенная красота»

Почему новостройки на Северном Кипре — это лучшее решение для жизни и инвестиций

Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Félix Auger-Aliassime

Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo


Специалисты Нацпроектстроя надвигают путепровод СБВ над путями МЦД-2

В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей

Продукты линейки СУБД ЛИНТЕР совместимы с ОС «АльтерОС»

Axenix и RightStep стали партнерами в области комплексной цифровизации промышленных предприятий


The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country

Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android



Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)


Chef's table и новое пространство ресторана «Интеллигенция»

Трое российских бойцов две недели ползли к своим позициям

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

МИД РФ заявил о готовности подписать документ о безъядерной зоне в Юго-Восточной Азии


Суд Москвы арестовал челябинского министра имущества Белоусова

В РПЦ назвали татуировки опознавательным знаком для дьявола

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек

Стратегию развития города Шахты до 2030 года скорректируют


Винус Уильямс получила wild card на турнир категории WTA 1000 в Цинциннати

Медведев победил У Ибина и вышел в четвертьфинал турнира ATP в Вашингтоне

Рублев вместе с чешской теннисисткой заявился в микст на US Open

Алекс де Минор вышел в 1/8 финала турнира ATP-500 в Вашингтоне


Ефимов: за лето к переселению по реновации приступили 10 тыс. москвичей

В 128 домах Тамбова качество горячего водоснабжения не соответствует нормативам

Суд над московской ячейкой «Фалуньгун»*: как опасная китайская секта попала в РФ

Стратегию развития города Шахты до 2030 года скорректируют


Музыкальные новости

Певица Вика Цыганова раскритиковала российских фанатов Оззи Осборна

На концерт классической музыки «Мне дорог Бах…» приглашают псковичей

Он не любил, когда наполовину: каким был Владимир Высоцкий

Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest


Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии


"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ

Брянские спортсмены победили на Чемпионате России по сверхлегкой авиации

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


В Москве на видео попало, как самокатчица влетела в авто с правоохранителями

В Подмосковье на видео попало, как школьник на питбайке разбился в жестком ДТП

В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы


У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Путин отметил успех российских школьников на олимпиаде по физике.

Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле


В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса

Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Косметолог-эстетист Наталья Рябинова: как правильно использовать масло для губ

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса


«Затрудняет путь в ЕС»: Урсула ждёт от Киева разъяснений по поводу ограничения полномочий НАБУ

Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского 

Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


Назначены судейские бригады на матчи 2-ого тура МИР РПЛ

"Атлетико" заключил соглашение с игроком национальной команды Словакии

"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

Делегация «ЛокоТех» посетила финал II чемпионата профессионалов ОАО «РЖД» в Екатеринбурге


Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.


Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом

Сергей Собянин. Главное за день

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова


6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.

В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала


Клуб Медиалиги «Амкал» предлагал Овечкину сыграть в Кубке России по футболу

Синоптик Позднякова прогнозирует отсутствие дождей в Москве до 29 июля

Суд арестовал продававшего сведения каналу Baza полицейского из Белгорода

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек


70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки


Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно


Суд Москвы арестовал челябинского министра имущества Белоусова

Суд завершил разбирательство по делу бывшего заместителя губернатора Челябинской области.

В Москве выросла доля ипотечных сделок с первичным жильем

На борту разбившегося Ан-24 находилась семья медиков из Тынды.














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *