IDP-LM: Prediction of protein intrinsic disorder and disorder functions based on language models
by Yihe Pang, Bin Liu
Intrinsically disordered proteins (IDPs) and regions (IDRs) are a class of functionally important proteins and regions that lack stable three-dimensional structures under the native physiologic conditions. They participate in critical biological processes and thus are associated with the pathogenesis of many severe human diseases. Identifying the IDPs/IDRs and their functions will be helpful for a comprehensive understanding of protein structures and functions, and inform studies of rational drug design. Over the past decades, the exponential growth in the number of proteins with sequence information has deepened the gap between uncharacterized and annotated disordered sequences. Protein language models have recently demonstrated their powerful abilities to capture complex structural and functional information from the enormous quantity of unlabelled protein sequences, providing opportunities to apply protein language models to uncover the intrinsic disorders and their biological properties from the amino acid sequences. In this study, we proposed a computational predictor called IDP-LM for predicting intrinsic disorder and disorder functions by leveraging the pre-trained protein language models. IDP-LM takes the embeddings extracted from three pre-trained protein language models as the exclusive inputs, including ProtBERT, ProtT5 and a disorder specific language model (IDP-BERT). The ablation analysis shown that the IDP-BERT provided fine-grained feature representations of disorder, and the combination of three language models is the key to the performance improvement of IDP-LM. The evaluation results on independent test datasets demonstrated that the IDP-LM provided high-quality prediction results for intrinsic disorder and four common disordered functions.
Аукцион за часть дачи Пугачевой опровергли
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Арбуз, кукуруза и холодные напитки: диетолог Садыков назвал продукты, которые портят ваш сон летом
Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)
La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo
Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch
Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."
Why Juventus spent 111m this summer for only one new player
Какие зарплаты нужны для получения льготного автокредита в 2025 году
Компания MONT расширила ИБ-портфель отечественной системой exploitDog
Первый маршрут теплохода-ресторана открылся из Петербурга в Кронштадт
В Фатеже два человека пострадали в ДТП
Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country
The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game
'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'
Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал
Кара небесная: людей какого типа молния поражает смертельным ударом
Месяц в открытом море: студенты ДВФУ отправятся в экспедицию на Камчатку
Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты
Математика Савватеева возмутило заявление о "лишних" учителях
Сразу до +35 градусов: синоптики рассказали, когда снова вернется жара. Ждать осталось недолго
Οфициaльнο: Ποcлeдний aвиaнοceц Ροccии xοтят οтпpaвить нa мeтaллοлοм
Как мы в Fix Price автоматизировали создание рекламных видео
После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам
Соболенко сохраняет первое место в чемпионской гонке WTA.
Медведев пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне
Теннисистка Калинская вышла в четвертьфинал турнира WTA 500 в Вашингтоне
Алекс де Минор вышел в 1/8 финала турнира ATP-500 в Вашингтоне
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам
Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена
Музыкальные новости
Оззи Осборна убила коварная болезнь
Брошенный женой Никита Пресняков круто изменил имидж
Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»
Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)
Аудиосказки про Турбозавров теперь на Яндекс Музыке!
В Смоленской области пройдёт IT-фестиваль «Мой Бизнес. Табтабус 2025»
Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»
Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено
Поезда не будут ходить на участке Сокольнической линии метро с 26 по 28 июля
"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"
Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Обнаружен новый штамм коронавируса: он очень заразный и забирает голос
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах
"Атлетико" заключил соглашение с игроком национальной команды Словакии
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне
Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию
Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве
Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.
Сергей Собянин. Главное за день
Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова
Собянин поддержал проведение конкурса «Лучший книжный магазин Москвы»
Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике
6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин
Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала
В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России
Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.
После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам
Οфициaльнο: Ποcлeдний aвиaнοceц Ροccии xοтят οтпpaвить нa мeтaллοлοм
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома
Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма
Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры
"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму
Прогноз погоды в Крыму на 25 июля
Автоэксперт Олег Мосеев: автопарк России на 71,3% состоит из машин старше 10 лет
После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам
Как мы в Fix Price автоматизировали создание рекламных видео
Вертолет Robinson, рухнувший в Телецкое озеро, совершал свой первый полет