Добавить новость
smi24.net
News in English
Ноябрь
2023

Resistome and virulome of high-risk pandemic clones of multidrug-resistant extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) isolated from tertiary healthcare settings in Uganda

0

by Denis K. Byarugaba, Bernard Erima, Godfrey Wokorach, Stephen Alafi, Hannah Kibuuka, Edison Mworozi, Ambrose K. Musinguzi, James Kiyengo, Florence Najjuka, Fred Wabwire-Mangen

Multi-drug resistant (MDR) globally disseminated extraintestinal pathogenic high-risk Escherichia coli (ExPEC) clones are threatening the gains in bacterial disease management. In this study, we evaluated the genomic structure including the resistome and virulome of the E. coli isolates from extraintestinal infections using whole genome sequencing (WGS). The results highlight that isolates were highly resistant (≥ 90.0%) to commonly used antibiotics (Ampicillin, Trimethoprim-Sulfamethoxazole, Nalidixic acid, and Piperacillin) and were less (<14%) resistant to last resort antibiotics; Imipenem (10.94%) and Meropenem (10.20%). A greater proportion of the E. coli isolates belonged to phylogroup B2 (30.52%) and phylogroup A (27.37%). The sequence types ST131 of phylogroup B2 (21.05%) and ST648 of phylogroup F (9.3%) were the dominant pandemic high-risk clones identified in addition to the ST1193, ST410, ST69, ST38, ST405, and ST10. Many of the isolates were MDR and most (64.58%) carried the blaCTX-M-15 gene for extended-spectrum β-lactamases. There was a high correlation between phylogroups and the occurrence of both antimicrobial resistance and virulence genes. The cephalosporin-resistance gene blaEC-5 was only found in phylogroup B2 while blaEC-8 and blaEC-19, were only found within phylogroup D and phylogroup F respectively. Aminoglycoside gene (aadA1) was only associated with phylogroups D and C. The isolates were armed with a broad range of virulence genes including adhesins, toxins, secreted proteases, iron uptake genes, and others. The yfcv, chuA, and kpsE genes preferentially occurred among isolates of phylogroup B2. The study underlines the predominance of MDR internationally disseminated high-risk ExPEC clones with a broad range of virulence genes known to be highly transmissible in healthcare and community settings.







Состоялось открытие фотовыставки «Особенная красота»

Ваше душевное благополучие важно: когда и как лечение в стационаре становится шагом к себе

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)


La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Félix Auger-Aliassime

Why Juventus spent 111m this summer for only one new player


Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса

Закат на планете Мангистау

Отдых в отеле, джип и частный дом: какие взятки мог получить экс-губернатор Тамбовской области


Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android



«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Квалификационные испытания на право ношения знака отличия полицейского спецназа Росгвардии завершились в Подмосковье (видео)

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии


МЧС предупредило москвичей о жаре до +30℃

Автоэксперт Олег Мосеев: автопарк России на 71,3% состоит из машин старше 10 лет

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Сразу до +35 градусов: синоптики рассказали, когда снова вернется жара. Ждать осталось недолго


«Провокация азербайджанской диаспоры»: в Москве уроженец Азербайджана угрожал насилием соседям и кичился своими связями

Отсидевший четыре года за сходство с мошенником не смог доказать невиновность

Синоптики спрогнозировали ясную погоду на выходных в Москве

Тихий и опасный. Новые виды коронавируса пошли в наступление и лишают голоса


Александр Бублик получил хорошую новость от ATP после завоевания титула

Сидоренко из России одержал победу и стал чемпионом по настольному теннису на Универсиаде.

Винус Уильямс получила wild card на турнир категории WTA 1000 в Цинциннати

Россиянин Сидоренко выиграл золото Универсиады в настольном теннисе


Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля

Пирамиды строили люди, а не инопланетяне: технологии на службе у науки

Кара небесная: людей какого типа молния поражает смертельным ударом

«Был пар и вибрация»: пассажиры жаловались на состояние Ан-24 перед катастрофой


Музыкальные новости

Аранжировка Песен. Аранжировка Музыки. Создание Аранжировок.

Баста и Шура снимаются в сериале «Вирус попсы»

«Я злая, хотя, тоже женщина»: жена Басты затравила беременную блогершу

Продюсер рассказал, почему заменил Shaman в опере «Князь Владимир»


Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива

Okko и ТНТ выпустят драмеди про трёх сестёр «Хай, систерс»

Алексей Учитель снимает фильм о композиторе Дмитрии Шостаковиче

Стратегическое партнерство России и Узбекистана укрепляет газохимическую отрасль обеих стран


В Подмосковье на видео попало, как школьник на питбайке разбился в жестком ДТП

В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

На международном ралли «Шелковый путь – 2025» представили новое моторное масло для мотоциклистов

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено


Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

Путин отметил успех российских школьников на олимпиаде по физике.

Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле


Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса

Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая


Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире

Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского 


"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах


Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию


Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Собянин поддержал проведение конкурса «Лучший книжный магазин Москвы»

Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова


6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

Детеныш краснокнижной боливийской обезьяны появился на свет в Московском зоопарке

В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала


Отсидевший четыре года за сходство с мошенником не смог доказать невиновность

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»

«Был пар и вибрация»: пассажиры жаловались на состояние Ан-24 перед катастрофой

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля


70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки


Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму

Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями


Прогноз погоды на сегодня, 25 июля

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля

Жители Хакасии подали 80 заявок на Слёт Всемирного фестиваля молодёжи

«Провокация азербайджанской диаспоры»: в Москве уроженец Азербайджана угрожал насилием соседям и кичился своими связями














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *