Supporting data for "Streamlining remote nanopore data access with slow5curl"
As adoption of nanopore sequencing technology continues to advance, the need to maintain large volumes of raw current signal data for reanalysis with updated algorithms is a growing challenge. Here we introduce slow5curl, a software package designed to streamline nanopore data sharing, accessibility and reanalysis.
Slow5curl allows a user to fetch a specified read or group of reads from a raw nanopore dataset stored on a remote server, such as a public data repository, without downloading the entire file.
Slow5curl uses an index to quickly fetch specific reads from a large dataset in SLOW5/BLOW5 format and highly parallelised data access requests to maximise download speeds. Using all public nanopore data from the Human Pangenome Reference Consortium (>22 TB), we demonstrate how
Slow5curl can be used to quickly fetch and reanalyse raw signal reads corresponding to a set of target genes from each individual in large cohort dataset (
n = 91), minimising the time, egress costs, and local storage requirements for their reanalysis. We provide
Slow5curl as a free, open-source package that will reduce frictions in data sharing for the nanopore community.
Читайте также:
Вчера 13:18
Вчера 13:07
Вчера 13:34
Вчера 14:06
Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)
Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет
Ваше душевное благополучие важно: когда и как лечение в стационаре становится шагом к себе
Кризис спроса: как выбрать надёжного застройщика в 2025 году
Why Juventus spent 111m this summer for only one new player
The Best Story Of Chicago Bulls’ Offseason Just Got A Happy Ending
The founder of Deliciously Ella started a blog when suffering from severe chronic pain. Now, her multimillion-dollar snack empire is going global
Пьяный курянин избил супругу и чуть не задушил её штанами из-за ревности
В МГУ создали ИИ-алгоритм для поиска скрытых форм молекул
Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты
Какие зарплаты нужны для получения льготного автокредита в 2025 году
The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game
Bungie promises to fix Destiny 2's new metroid-style morph ball as it makes players sick and glitches out on ultrawide monitors
'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'
Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android
Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет
Акция «Каникулы с Росгвардией» продолжается в Чеченской Республике
Кризис спроса: как выбрать надёжного застройщика в 2025 году
Медлить — не время. «Выберу.ру» подготовил рейтинг лучших пенсионных вкладов в июле 2025 года
Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»
Молодежь Подмосковья приглашают принять участие в конкурсе к 295-летию русского полководца Александра Суворова
Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет
СК: в Москве задержали главреда Telegram-канала Baza Глеба Трифонова
Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье
«Алиев — лишь инструмент»: эксперт о закулисье конфликта Баку и Москвы
В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей
ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ
«Следующая остановка — Монреаль!» Потапова полетела в Канаду для участия в «тысячнике»
Бублик стал победителем турнира в Гштаде.
Мирра Андреева из России удерживает пятую позицию в рейтинге WTA.
Александр Бублик получил хорошую новость от ATP после завоевания титула
МИД развеял фейк об «изоляции» Лаврова, напомнив о сотне встреч
Следствие ходатайствует об аресте журналистов Baza Трифонова и Лукьяновой
Мебель, которой доверяют профессионалы — в "Аверсе"
Прокуратура поставила на контроль выяснение причин пожара на Мытной улице
Музыкальные новости
Ростовский-на-Дону ЭРЗ ввёл в эксплуатацию новый прошивной станок
Почему дочь Волочковой с "рекордным шпагатом" сбежала от матери и тайно обвенчалась вопреки ее воле
В сказке были: Джиган на сеновале, IOWA с картины Шагала
В Петербурге требуют заблокировать сайты, продающие липовые билеты в Мариинку
В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей
Акция «Каникулы с Росгвардией» продолжается в Чеченской Республике
Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет
Медлить — не время. «Выберу.ру» подготовил рейтинг лучших пенсионных вкладов в июле 2025 года
Роскосмос опубликовал снимок циклона, который обрушился на Москву
The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game
Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»
Стратегическое партнерство России и Узбекистана укрепляет газохимическую отрасль обеих стран
Москвичей предупредили о задержках наземного транспорта из-за ливня
Столичные росгвардейцы оказали помощь мотоциклистке, пострадавшей в ДТП
Столичные росгвардейцы оказали помощь мотоциклистке, пострадавшей в ДТП
Сильный ливень заблокировал людей в авто в центре Москвы
В Москве скончалась подруга Путина, которая рассказывала о его молодости: «Нам он как мужчина не нравился»
"Путин имеет свои границы: Британия оценила слова Трампа"
Министр юстиции поделился информацией о роли адвокатов в специальной военной операции.
Путин провел встречу с министром юстиции.
Врач-гигиенист клиники «Мегастом» Инна Гришина: сколько нужно чистить зубы
После вспышки инфекции на теплоходе «Леонид Красин» начали расследование
Собянин: создание 5 центров женского здоровья завершат в этом году
Трихолог Мадина Осман: типы алопеции и методы борьбы с ними
Axios: закон о НАБУ может спровоцировать Трампа на новую волну критики Киева
В центре Киева митингуют против реформ Зеленского
ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ
Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби
Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»
Росгвардия обеспечила безопасность финиша международного ралли «Шелковый путь»
Лукашенко призвал белорусских нефтяников «не раскачиваться, а бурить и бурить»
Посланник Трампа рассказал, как «неформально» договаривался с Лукашенко: после нескольких тостов Минск освободил политзаключенных
Собянин: Модернизация двух корпусов ГКБ имени Вересаева завершится в этом году
Собянин: Продолжаем внедрять новый стандарт заботы о женском здоровье в одном месте
Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве - Сергей Собянин
Мишустин поучаствует в Международной экологической конференции на Алтае
Уже 59 орловчан решили побороться за просветительскую награду «Знание. Премия»
Россияне рассказали, по каким критериям выбирают квартиру для покупки в 2025 году
Зарядки для электромобилей «Энергия Москвы» станут платными
Захарова осудила попытки «отмены культуры» со стороны Италии
МИД развеял фейк об «изоляции» Лаврова, напомнив о сотне встреч
В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей
Защита главреда Baza назвала готовых за него поручиться, включая Собчак
Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
В Башкирии ревнивец ранил жену шампуром и сдался полиции
Центр подготовки личного состава Северо-Западного округа Росгвардии пополнили призывники
В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями
В Симферополе наградили юных крымчан за отвагу и решительность
Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области
Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно
Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье
В Москве доставили в суд главреда Baza Трифонова и продюсера Лукьянову
Володин раскритиковал Чехию за сравнение коммунистической идеологии с фашистской
ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ