Добавить новость
smi24.net
News in English
Март
2024

Supporting data for "Streamlining remote nanopore data access with slow5curl"

0
As adoption of nanopore sequencing technology continues to advance, the need to maintain large volumes of raw current signal data for reanalysis with updated algorithms is a growing challenge. Here we introduce slow5curl, a software package designed to streamline nanopore data sharing, accessibility and reanalysis. Slow5curl allows a user to fetch a specified read or group of reads from a raw nanopore dataset stored on a remote server, such as a public data repository, without downloading the entire file. Slow5curl uses an index to quickly fetch specific reads from a large dataset in SLOW5/BLOW5 format and highly parallelised data access requests to maximise download speeds. Using all public nanopore data from the Human Pangenome Reference Consortium (>22 TB), we demonstrate how Slow5curl can be used to quickly fetch and reanalyse raw signal reads corresponding to a set of target genes from each individual in large cohort dataset (n = 91), minimising the time, egress costs, and local storage requirements for their reanalysis. We provide Slow5curl as a free, open-source package that will reduce frictions in data sharing for the nanopore community.







По итогам первого полугодия 2025 года предприятия «ЛокоТех-Сервис» отремонтировали более 1 тыс. секций локомотивов сверх плана и повысили качество сервисного обслуживания

Баскова, Киркорова и Лазарева погнали с экранов: попались на непотребщине

Тротуарная плитка: как выбрать материал, который простоит десятилетия

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Madeline Brewer Marries Jack Thompson-Roylance in England!

Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch

La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur


В лобовом столкновении кроссовера и грузовика погибли два человека

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Monochamus scutellatus

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России


Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country

Первый трейлер Battlefield 6

Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'



В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы


Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Young Posse впервые выступят в России. Партнер – Like FM

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России


В.В. ПУТИН И Д.А. МЕДВЕДЕВ МОГУТ ПОМОЧЬ ЗНАЧИТЕЛЬНО ДОПОЛНИТЕЛЬНО СДЕРЖИВАТЬ НАТО. СЕНСАЦИЯ! Россия, США, Европа могут улучшить отношения и здоровье общества!

покой души

Бодо Бородо выпустил трек «Бодо-рэпо-алфавит»

Томскую организацию уличили в покупке оборудования для БПЛА по завышенной цене


Фриц пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне.

Винус Уильямс — самая возрастная победительница матча WTA с 2004 года

Потапова проиграла 88-й ракетке мира на старте турнира WTA в Вашингтоне

«Время ещё есть, чтобы выиграть «Большой шлем». Хачанов заскочил в Москву перед US Open


Росгвардия и МЧС провели совместные учения в Москве

На слет Всемирного фестиваля молодежи подали более 62 тыс. заявок из 175 стран

В мэрии назвали условия присвоения Элджею звания почётного жителя

Бодо Бородо выпустил трек «Бодо-рэпо-алфавит»


Музыкальные новости

Любовь Толкалина: «Ушла от Кончаловского к самому лучшему человеку на Земле — Борису Гребенщикову»

«Молодежь любит так же, как мы»: Баста рассказал о смыслах своего мюзикла

Кажетта Ахметжанова: 5 камней для усиления женской энергии

В Петербурге требуют заблокировать сайты, продающие липовые билеты в Мариинку


Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы

Росгвардия и МЧС провели совместные учения в Москве

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры


Отношения с Трампом не сложились: Путин зол. Ультиматум США вышел боком

Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

РОСГВАРДИЯ ОБЕСПЕЧИЛА ПРАВОПОРЯДОК НА ФУТБОЛЬНОМ МАТЧЕ РПЛ В ГРОЗНОМ


В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники

На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

Надеждину отказали в исключении его автомобиля из конкурсной массы.

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

В сентябре Путину будет представлена обновленная программа строительства кораблей для ВМФ.

Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры




Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.



Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах

Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много

"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне


Сергей Собянин. Главное за день


Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.

В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России


Больше 20 поездов задерживаются из-за падения обломков БПЛА на юге России (Обновлено!)

На слет Всемирного фестиваля молодежи подали более 62 тыс. заявок из 175 стран

Локомотивное депо "Белогорск" повышает эффективность мойки деталей локомотивов

Бодо Бородо выпустил трек «Бодо-рэпо-алфавит»


Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома


Прогноз погоды в Крыму на 25 июля

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

В центре Балаклавы изменят дорожное движение – причины и сроки

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму


Росгвардия и МЧС провели совместные учения в Москве

Елена Игоревна Вселенная — писатель, публицист, автор масштабного многотомного проекта «Наследие России»

Томскую организацию уличили в покупке оборудования для БПЛА по завышенной цене

В мэрии назвали условия присвоения Элджею звания почётного жителя














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *