Добавить новость
smi24.net
News in English
Март
2024

Supporting data for "Streamlining remote nanopore data access with slow5curl"

0
As adoption of nanopore sequencing technology continues to advance, the need to maintain large volumes of raw current signal data for reanalysis with updated algorithms is a growing challenge. Here we introduce slow5curl, a software package designed to streamline nanopore data sharing, accessibility and reanalysis. Slow5curl allows a user to fetch a specified read or group of reads from a raw nanopore dataset stored on a remote server, such as a public data repository, without downloading the entire file. Slow5curl uses an index to quickly fetch specific reads from a large dataset in SLOW5/BLOW5 format and highly parallelised data access requests to maximise download speeds. Using all public nanopore data from the Human Pangenome Reference Consortium (>22 TB), we demonstrate how Slow5curl can be used to quickly fetch and reanalyse raw signal reads corresponding to a set of target genes from each individual in large cohort dataset (n = 91), minimising the time, egress costs, and local storage requirements for their reanalysis. We provide Slow5curl as a free, open-source package that will reduce frictions in data sharing for the nanopore community.







Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)

Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет

Ваше душевное благополучие важно: когда и как лечение в стационаре становится шагом к себе

Кризис спроса: как выбрать надёжного застройщика в 2025 году


Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

The Best Story Of Chicago Bulls’ Offseason Just Got A Happy Ending

Félix Auger-Aliassime

The founder of Deliciously Ella started a blog when suffering from severe chronic pain. Now, her multimillion-dollar snack empire is going global


Пьяный курянин избил супругу и чуть не задушил её штанами из-за ревности

В МГУ создали ИИ-алгоритм для поиска скрытых форм молекул

Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты

Какие зарплаты нужны для получения льготного автокредита в 2025 году


The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

Bungie promises to fix Destiny 2's new metroid-style morph ball as it makes players sick and glitches out on ultrawide monitors

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android



Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет

Акция «Каникулы с Росгвардией» продолжается в Чеченской Республике

Кризис спроса: как выбрать надёжного застройщика в 2025 году

Медлить — не время. «Выберу.ру» подготовил рейтинг лучших пенсионных вкладов в июле 2025 года


Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Молодежь Подмосковья приглашают принять участие в конкурсе к 295-летию русского полководца Александра Суворова

Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет

СК: в Москве задержали главреда Telegram-канала Baza Глеба Трифонова


Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье

«Алиев — лишь инструмент»: эксперт о закулисье конфликта Баку и Москвы

В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей

ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ


«Следующая остановка — Монреаль!» Потапова полетела в Канаду для участия в «тысячнике»

Бублик стал победителем турнира в Гштаде.

Мирра Андреева из России удерживает пятую позицию в рейтинге WTA.

Александр Бублик получил хорошую новость от ATP после завоевания титула


МИД развеял фейк об «изоляции» Лаврова, напомнив о сотне встреч

Следствие ходатайствует об аресте журналистов Baza Трифонова и Лукьяновой

Мебель, которой доверяют профессионалы — в "Аверсе"

Прокуратура поставила на контроль выяснение причин пожара на Мытной улице


Музыкальные новости

Ростовский-на-Дону ЭРЗ ввёл в эксплуатацию новый прошивной станок

Почему дочь Волочковой с "рекордным шпагатом" сбежала от матери и тайно обвенчалась вопреки ее воле

В сказке были: Джиган на сеновале, IOWA с картины Шагала

В Петербурге требуют заблокировать сайты, продающие липовые билеты в Мариинку


В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей

Акция «Каникулы с Росгвардией» продолжается в Чеченской Республике

Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет

Медлить — не время. «Выберу.ру» подготовил рейтинг лучших пенсионных вкладов в июле 2025 года


Роскосмос опубликовал снимок циклона, который обрушился на Москву

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Стратегическое партнерство России и Узбекистана укрепляет газохимическую отрасль обеих стран


Москвичей предупредили о задержках наземного транспорта из-за ливня

Столичные росгвардейцы оказали помощь мотоциклистке, пострадавшей в ДТП

Столичные росгвардейцы оказали помощь мотоциклистке, пострадавшей в ДТП

Сильный ливень заблокировал людей в авто в центре Москвы


В Москве скончалась подруга Путина, которая рассказывала о его молодости: «Нам он как мужчина не нравился»

"Путин имеет свои границы: Британия оценила слова Трампа"

Министр юстиции поделился информацией о роли адвокатов в специальной военной операции.

Путин провел встречу с министром юстиции.




Врач-гигиенист клиники «Мегастом» Инна Гришина: сколько нужно чистить зубы

После вспышки инфекции на теплоходе «Леонид Красин» начали расследование

Собянин: создание 5 центров женского здоровья завершат в этом году

Трихолог Мадина Осман: типы алопеции и методы борьбы с ними


Axios: закон о НАБУ может спровоцировать Трампа на новую волну критики Киева

В центре Киева митингуют против реформ Зеленского


ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Росгвардия обеспечила безопасность финиша международного ралли «Шелковый путь»


Лукашенко призвал белорусских нефтяников «не раскачиваться, а бурить и бурить»

Посланник Трампа рассказал, как «неформально» договаривался с Лукашенко: после нескольких тостов Минск освободил политзаключенных


Собянин: Модернизация двух корпусов ГКБ имени Вересаева завершится в этом году

Собянин: Продолжаем внедрять новый стандарт заботы о женском здоровье в одном месте

Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве - Сергей Собянин


Мишустин поучаствует в Международной экологической конференции на Алтае

Уже 59 орловчан решили побороться за просветительскую награду «Знание. Премия»

Россияне рассказали, по каким критериям выбирают квартиру для покупки в 2025 году

Зарядки для электромобилей «Энергия Москвы» станут платными


Захарова осудила попытки «отмены культуры» со стороны Италии

МИД развеял фейк об «изоляции» Лаврова, напомнив о сотне встреч

В Московской области задержан томский предприниматель, укравший 8,5 млн рублей

Защита главреда Baza назвала готовых за него поручиться, включая Собчак


Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

В Башкирии ревнивец ранил жену шампуром и сдался полиции

Центр подготовки личного состава Северо-Западного округа Росгвардии пополнили призывники


В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

В Симферополе наградили юных крымчан за отвагу и решительность

Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно


Бастрыкин поставил на контроль дело об избиении мужчиной ребенка в Подмосковье

В Москве доставили в суд главреда Baza Трифонова и продюсера Лукьянову

Володин раскритиковал Чехию за сравнение коммунистической идеологии с фашистской

ЦСКА подписал контракт с нападающим Спронгом, выступавшим в НХЛ














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *