Supporting data for "Streamlining remote nanopore data access with slow5curl"
As adoption of nanopore sequencing technology continues to advance, the need to maintain large volumes of raw current signal data for reanalysis with updated algorithms is a growing challenge. Here we introduce slow5curl, a software package designed to streamline nanopore data sharing, accessibility and reanalysis.
Slow5curl allows a user to fetch a specified read or group of reads from a raw nanopore dataset stored on a remote server, such as a public data repository, without downloading the entire file.
Slow5curl uses an index to quickly fetch specific reads from a large dataset in SLOW5/BLOW5 format and highly parallelised data access requests to maximise download speeds. Using all public nanopore data from the Human Pangenome Reference Consortium (>22 TB), we demonstrate how
Slow5curl can be used to quickly fetch and reanalyse raw signal reads corresponding to a set of target genes from each individual in large cohort dataset (
n = 91), minimising the time, egress costs, and local storage requirements for their reanalysis. We provide
Slow5curl as a free, open-source package that will reduce frictions in data sharing for the nanopore community.
Ваше душевное благополучие важно: когда и как лечение в стационаре становится шагом к себе
В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки
Рэпер Баста открыл свой ресторан в Marins Park Hotel Екатеринбург
Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)
Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur
Madeline Brewer Marries Jack Thompson-Roylance in England!
Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."
La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo
Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты
Axenix и RightStep стали партнерами в области комплексной цифровизации промышленных предприятий
В Челябинске арестован председатель правления банка "Снежинский"
Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes
Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country
Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'
Первый трейлер Battlefield 6
В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры
Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы
«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России
В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей
В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки
Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка
Ветеринары напомнили жителям Подмосковья о необходимости вакцинации питомцев
В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал
Тихий и опасный. Новые виды коронавируса пошли в наступление и лишают голоса
В Ростовской области обломки БПЛА привели к задержке 10 пассажирских поездов
Теннисистка Саккари спасла жука во время матча на турнире в США
Болбой раздавил спасенного теннисисткой Cаккари жука на турнире WTA-500 в США
Мальцев и Платонова взяли серебро ЧМ, Бублик вышел в полуфинал Кицбюэля. Главное к утру
«Следующая остановка — Монреаль!» Потапова полетела в Канаду для участия в «тысячнике»
Блогер Сатир о судах с «Орлом и решкой» из-за Ивлеевой и романе с Кищук
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля
Кара небесная: людей какого типа молния поражает смертельным ударом
Музыкальные новости
На концерт классической музыки «Мне дорог Бах…» приглашают псковичей
Врач Шуров: Оззи Осборн мог умереть от паркинсонизма
Девушка Рая отреагировала на использование ее лица во время выступления Элджея
Аукцион за часть дачи Пугачевой опровергли
В Санкт-Петербурге обсудили внедрение ИИ в разработку и оптимальные корпоративные архитектуры
Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка
«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России
Технологии будущего: MGIMO Ventures объявляет старт четвертого сезона акселерационной программы
"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом
Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest
Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники
На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено
Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы
Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем
"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"
Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса
Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Штамм коронавируса "стратус" захватил 22% всех вирусных заболеваний в Москве
Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"
Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах
Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне
Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию
Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.
Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве
Сергей Собянин осмотрел Дом-музей Федора Конюхова
Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом
Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова
Сергей Собянин. Главное за день
Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.
Бурмистров: лисы могут появляться на улицах Москвы в период расселения
6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин
В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России
На Крымском мосту восстановили движение автотранспорта
Трагедия для всей России: наша любимая актриса из "Служебного романа" скончалась на 82-м году жизни
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
Тихий и опасный. Новые виды коронавируса пошли в наступление и лишают голоса
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.
70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский
В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома
В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями
"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму
В центре Балаклавы изменят дорожное движение – причины и сроки
Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры
Трагедия для всей России: наша любимая актриса из "Служебного романа" скончалась на 82-м году жизни
Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД
Тихий и опасный. Новые виды коронавируса пошли в наступление и лишают голоса
На Крымском мосту восстановили движение автотранспорта