Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
by Samuel H. Church, Jasmine L. Mah, Casey W. Dunn
Comparisons of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data across species can reveal links between cellular gene expression and the evolution of cell functions, features, and phenotypes. These comparisons evoke evolutionary histories, as depicted by phylogenetic trees, that define relationships between species, genes, and cells. This Essay considers each of these in turn, laying out challenges and solutions derived from a phylogenetic comparative approach and relating these solutions to previously proposed methods for the pairwise alignment of cellular dimensional maps. This Essay contends that species trees, gene trees, cell phylogenies, and cell lineages can all be reconciled as descriptions of the same concept—the tree of cellular life. By integrating phylogenetic approaches into scRNA-seq analyses, challenges for building informed comparisons across species can be overcome, and hypotheses about gene and cell evolution can be robustly tested.
Арбуз, кукуруза и холодные напитки: диетолог Садыков назвал продукты, которые портят ваш сон летом
Арбуз, кукуруза и холодные напитки: диетолог Садыков назвал продукты, которые портят ваш сон летом
Paul Oakenfold возвращается в Россию: легенда электронной музыки даст концерты в Москве и Петербурге спустя 7 лет
Гордости Angsana Velavaru
Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."
Why Juventus spent 111m this summer for only one new player
Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur
La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo
Раздвигая горы - к единству и созиданию! Манифест лезгинского народа (письменное обращение, воззвание программного характера)
В Курской области женщину осудили за нанесение ножевых ранений двум приятелям
Navicon представляет комплексную систему для интегрированного управления данными
Компания MONT расширила ИБ-портфель отечественной системой exploitDog
Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes
Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'
'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'
The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
В МЧС предупредили москвичей о жаре +30 градусов 25 июля
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей
Автоэксперт Олег Мосеев: автопарк России на 71,3% состоит из машин старше 10 лет
Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена
В Главном управлении ФССП России по Московской области состоялось заседание коллегии
Врач Галлямова: сухие шампуни могут навредить коже головы
В Ярославской области регистрировалось три групповых очага кори
Винус Уильямс — самая возрастная победительница матча WTA с 2004 года
Алекс де Минор вышел в 1/8 финала турнира ATP-500 в Вашингтоне
Соболенко сохраняет первое место в чемпионской гонке WTA.
Винус Уильямс: Если Серена вернется, она даст вам знать
Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего
Обрушившийся потолок забаррикадировал четыре квартиры на востоке Москвы
В Ростовской области обломки БПЛА привели к задержке 10 пассажирских поездов
Отсидевший четыре года за сходство с мошенником не смог доказать невиновность
Музыкальные новости
Пир на Волге и Башмет: какие праздники ждут Ярославль в августе
Оззи Осборна убила коварная болезнь
Невозможное возможно: две подопечные фонда «Жизнь в Движении» с ограниченными возможностями покорят вершину Эльбруса
Рэпер Баста открыл свой ресторан в Marins Park Hotel Екатеринбург
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Ростовский-на-Дону ЭРЗ ввёл в эксплуатацию новый прошивной станок
«Спартак» - «Балтика»: прогноз + статистика встреч
Назначены судейские бригады на матчи 2-ого тура МИР РПЛ
На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено
Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы
На международном ралли «Шелковый путь – 2025» представили новое моторное масло для мотоциклистов
В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)
Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Путин отметил успех российских школьников на олимпиаде по физике.
Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле
В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса
Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Депздрав: новый штамм коронавируса «стратус» фиксируют в Москве с мая
Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса
Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая
Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек
Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.
Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России
Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире
Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского
Пять земельных участков для размещения НКО доступны на городских торгах
"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом
«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России
"Атлетико" заключил соглашение с игроком национальной команды Словакии
Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.
Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне
Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве
Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию
Сергей Собянин. Главное за день
Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова
Собянин: Около 10 тыс. москвичей начали переселение по реновации этим летом
Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике
Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала
Детеныш краснокнижной боливийской обезьяны появился на свет в Московском зоопарке
Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.
В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России
Михаил Ефремов разъехался с женой на фоне новостей о разводе
Сотрудники Волоколамского ОВО – филиала ФГКУ «УВО ВНГ России по Московской области» приняли участие в памятных мероприятиях, посвященных Дню ветерана боевых действий.
Отсидевший четыре года за сходство с мошенником не смог доказать невиновность
Жертва перестройки — почему эта Волга была обречена
70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский
Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P
В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома
Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки
Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области
Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма
В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями
"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму
Патрушев: НАТО усиливает давление у морских границ России
Математика Савватеева возмутило заявление о "лишних" учителях
Движeниe нa Зaпοpοжьe: pοccийcκиe вοйcκa ɜaшли в Ϲтeпнοгοpcκ
Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена