Добавить новость
smi24.net
News in English
Май
2024

Efficient wastewater sample filtration improves the detection of SARS-CoV-2 variants: An extensive analysis based on sequencing parameters

0

by Angelo Robotto, Carlotta Olivero, Elisa Pozzi, Claudia Strumia, Camilla Crasà, Cristina Fedele, Maddalena Derosa, Massimo Di Martino, Stefania Latino, Giada Scorza, Andrea Civra, David Lembo, Paola Quaglino, Enrico Brizio, Denis Polato

During the SARS-CoV-2 pandemic, many countries established wastewater (WW) surveillance to objectively monitor the level of infection within the population. As new variants continue to emerge, it has become clear that WW surveillance is an essential tool for the early detection of variants. The EU Commission published a recommendation suggesting an approach to establish surveillance of SARS-CoV-2 and its variants in WW, besides specifying the methodology for WW concentration and RNA extraction. Therefore, different groups have approached the issue with different strategies, mainly focusing on WW concentration methods, but only a few groups highlighted the importance of prefiltering WW samples and/or purification of RNA samples. Aiming to obtain high-quality sequencing data allowing variants detection, we compared four experimental conditions generated from the treatment of: i) WW samples by WW filtration and ii) the extracted RNA by DNase treatment, purification and concentration of the extracted RNA. To evaluate the best condition, the results were assessed by focusing on several sequencing parameters, as the outcome of SARS-CoV-2 sequencing from WW is crucial for variant detection. Overall, the best sequencing result was obtained by filtering the WW sample. Moreover, the present study provides an overview of some sequencing parameters to consider when optimizing a method for monitoring SARS-CoV-2 variants from WW samples, which can also be applied to any sample preparation methodology.







Звезды тогда и сейчас: как выглядят самые красивые женщины Голливуда

Любовь в сердце и в «Тропикана Парк»

Летняя школа Русского дома приняла детей из Карабаха

В РФ разработали систему голосового скрининга для диагностики болезни Паркинсона


Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

OpenAI warns that its new ChatGPT Agent has the ability to aid dangerous bioweapon development

The Best Story Of Chicago Bulls’ Offseason Just Got A Happy Ending

Tourism is increasing over prepandemic levels, overwhelming popular destinations


В Челябинске арестован председатель правления банка "Снежинский"

Хаски на Summer Sound – выиграй билеты на Like FM

Конференцию Infotecs Marketing Stars в Кибердоме посетили более 500 специалистов по маркетингу и рекламе в сфере ИТ и ИБ

Спрос на авиаперевозки в Китай вырос почти на четверть с начала 2025 года – «Деловые Линии»


Bungie promises to fix Destiny 2's new metroid-style morph ball as it makes players sick and glitches out on ultrawide monitors

Настройки GameHub и Winlator для игры в Prey (2017) на Android

Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game



Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

Аудиосказки про Турбозавров теперь на Яндекс Музыке!

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Летняя школа Русского дома приняла детей из Карабаха


Ярко вспыхнула и быстро погасла: судьба певицы Марины Журавлевой

Двоих задержанных сотрудников Telegram-канала Baza отпустили из столичного СК

Лицемерная политика многовекторности. "Улыбается всем": Эрдоган в обход Москвы готов дружить с Баку

Хаски на Summer Sound – выиграй билеты на Like FM


Закупки госкомпаний у МСП превысили 3,8 трлн рублей в первом полугодии 2025 года

«Для нас это тоже чудо»: бегун-юниор Данилов побил рекорд, установленный на Олимпиаде-1980

Пост №6137249

За какие заслуги такой жир: бывшая и нынешняя жены Николая Сердюкова похвастались шикарными квартирами – простому человеку такое и во сне не снится


Рублев вместе с чешской теннисисткой заявился в микст на US Open

Потапова не прошла во второй раунд турнира в Вашингтоне.

Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP

Теннисистка Мур высказалась о проблемах в антидопинговой системе.


Москвичей призвали во вторник ездить на метро из-за дождя

Город продал и передал в аренду более 7,5 га земли для строительства недвижимости за полгода по итогам торгов

Молодежь Подмосковья приглашают принять участие в конкурсе к 295-летию русского полководца Александра Суворова

Лесная охрана провела свыше тысячи патрулирований в Подмосковье за неделю


Музыкальные новости

Элджей во время выступления на VK Fest поцеловал свою девушку: видео Super

Летов в ритме джаза: звуковой эксперимент, который покорит сердца слушателей

Отреставрировать стену Цоя на Арбате к сроку не успели, закончат в ближайшие дни

В сказке были: Джиган на сеновале, IOWA с картины Шагала


Летняя школа Русского дома приняла детей из Карабаха

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Аудиосказки про Турбозавров теперь на Яндекс Музыке!

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби


Аэропорт Пулково сообщил о приеме перенаправленных из Москвы рейсов

В новый сезон: Сегодня ФК «Оренбург» на своем поле принимает ЦСКА из Москвы

Лео Канделаки и Анжелика Стубайло сыграют в новую трэвел-игру «Кто куда» на ТНТ

Собянин: еще два беспилотника, летевших на Москву, были ликвидированы


25 июля пилотажная группа "Звезда" пролетит над пробками на шоссе под Москвой

Сильный ливень заблокировал людей в авто в центре Москвы

Рискнул на 100 тысяч рублей: инженер из Смоленска купил более 1,7 тысячи лотерейных билетов и выиграл автомобиль от «Национальной Лотереи» и РОЛЬФ на VK Fest

Москвичей предупредили о задержках наземного транспорта из-за ливня


Министр юстиции поделился информацией о роли адвокатов в специальной военной операции.

Путин отметил победу синхрониста Мальцева на чемпионате мира в Сингапуре.

Путин выразил соболезнования семье председателя Верховного суда Подносовой

Путин отметил успехи российских школьников на математической олимпиаде.




«Я на инвалидном кресле, он на «Тесле»: что случилось с блогером Мариш Мариш

Офтальмолог Кирилл Светлаков: секреты здоровых глаз для тех, кто носит контактные линзы

После вспышки инфекции на теплоходе «Леонид Красин» начали расследование

Собянин: создание 5 центров женского здоровья завершат в этом году


В центре Киева митингуют против реформ Зеленского

«СТРАНА.ua»: Зеленский раскритиковал ЕС за непредоставление обещанной помощи


Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»

Кайрат Бермуканов поддержал Петра Яна перед боем в Абу‑Даби

В Москве впервые пройдет фестиваль экстремальных видов спорта

Уже 59 орловчан решили побороться за просветительскую награду «Знание. Премия»


Куда Лукашенко хочет пристроить лишних дипломатов

Посланник Трампа рассказал, как «неформально» договаривался с Лукашенко: после нескольких тостов Минск освободил политзаключенных

Лукашенко призвал белорусских нефтяников «не раскачиваться, а бурить и бурить»

Юрист Трампа Коул рассказал, как пил водку с Лукашенко в Минске


Собянин рассказал, как город заботится о природе при строительстве метро

Собянин: Продолжаем внедрять новый стандарт заботы о женском здоровье в одном месте

Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве — Сергей Собянин

Более 800 спортивных площадок обновят и обустроят в Москве - Сергей Собянин


Уже 59 орловчан решили побороться за просветительскую награду «Знание. Премия»

Россияне рассказали, по каким критериям выбирают квартиру для покупки в 2025 году

Фестиваль «Сады и цветы»: как Москву превращают в городской оазис

Зарядки для электромобилей «Энергия Москвы» станут платными


Лесная охрана провела свыше тысячи патрулирований в Подмосковье за неделю

Уголовные дела и обыски: силовики пришли к полицейским, сливавшим информацию в крупные ТГ-каналы (ФОТО, ВИДЕО)

Названы самые популярные имена для новорожденных детей в Подмосковье

Город продал и передал в аренду более 7,5 га земли для строительства недвижимости за полгода по итогам торгов


Центр подготовки личного состава Северо-Западного округа Росгвардии пополнили призывники

Девочка упала при посадке на теплоход в порту Архангельска

Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома


Поезда в Крым и из Крыма следуют с задержками до пяти часов

Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно


Мария Шувалова. В столице Татарстана чествовали балетную диву за блистательную «Анюту»

Бесплатный курс и бесплатное обучение дизайну с личным наставником. Веб дизайн, UX дизайн, графический дизайн, дизайн для маркетплейсов

Круизные компании сообщают об изменении маршрутов теплоходов из-за аварии на Городецком гидроузле

Может сделать реально больно: в США назвали козыри Трампа против РФ














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *