Добавить новость
smi24.net
News in English
Май
2024

Efficient wastewater sample filtration improves the detection of SARS-CoV-2 variants: An extensive analysis based on sequencing parameters

0

by Angelo Robotto, Carlotta Olivero, Elisa Pozzi, Claudia Strumia, Camilla Crasà, Cristina Fedele, Maddalena Derosa, Massimo Di Martino, Stefania Latino, Giada Scorza, Andrea Civra, David Lembo, Paola Quaglino, Enrico Brizio, Denis Polato

During the SARS-CoV-2 pandemic, many countries established wastewater (WW) surveillance to objectively monitor the level of infection within the population. As new variants continue to emerge, it has become clear that WW surveillance is an essential tool for the early detection of variants. The EU Commission published a recommendation suggesting an approach to establish surveillance of SARS-CoV-2 and its variants in WW, besides specifying the methodology for WW concentration and RNA extraction. Therefore, different groups have approached the issue with different strategies, mainly focusing on WW concentration methods, but only a few groups highlighted the importance of prefiltering WW samples and/or purification of RNA samples. Aiming to obtain high-quality sequencing data allowing variants detection, we compared four experimental conditions generated from the treatment of: i) WW samples by WW filtration and ii) the extracted RNA by DNase treatment, purification and concentration of the extracted RNA. To evaluate the best condition, the results were assessed by focusing on several sequencing parameters, as the outcome of SARS-CoV-2 sequencing from WW is crucial for variant detection. Overall, the best sequencing result was obtained by filtering the WW sample. Moreover, the present study provides an overview of some sequencing parameters to consider when optimizing a method for monitoring SARS-CoV-2 variants from WW samples, which can also be applied to any sample preparation methodology.







По итогам первого полугодия 2025 года предприятия «ЛокоТех-Сервис» отремонтировали более 1 тыс. секций локомотивов сверх плана и повысили качество сервисного обслуживания

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Гордости Angsana Velavaru


Brit Who Fought Usyk Calls For Daniel Dubois To ‘Leave The Sport’ After Staying Down In Rematch

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Why Juventus spent 111m this summer for only one new player

La UFC anuncia un mes de octubre mayúsculo


Продукты линейки СУБД ЛИНТЕР совместимы с ОС «АльтерОС»

Первый маршрут теплохода-ресторана открылся из Петербурга в Кронштадт

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

НПС построит новые съезды с Северо-Восточной хорды


Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'

Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country



«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

«Деловые Линии» сократили сроки авиаперевозок по более чем 4400 направлений по России

В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива


Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты

В студии Детского радио прошла церемония гашения почтовой марки

Жертва перестройки — почему эта Волга была обречена

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


Ученый Толстых объяснил, что московские ливни вызваны мощным атлантическим циклоном

Солнечная погода и до 29 градусов тепла ожидаются в Москве 25 июля

После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам

В Правительстве прошщло совещание по реализации проекта строительства ВСМ Москва – Санкт-Петербург


Медведев сравнил матчи с Опелкой в Нидерландах и США

Медведев пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне

«Следующая остановка — Монреаль!» Потапова полетела в Канаду для участия в «тысячнике»

Медведев победил У Ибина и вышел в четвертьфинал турнира ATP в Вашингтоне


Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена

Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам


Музыкальные новости

Даже Пугачева оценила: Олег Меньшиков показал, как отдыхает в Италии

AI Певица. Создание AI Певицы. AI Певец. AI Артист.

Симона Юнусова честно высказалась о популярности своего сына Тимати

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


В депо «Чита» будет установлен первый цифровой весоизмерительный комплекс системы подачи песка под колесные пары локомотива

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Локомотивное депо "Белогорск" повышает эффективность мойки деталей локомотивов

Инсайдер Карпов: "Спартак" предложил "Динамо" Мх за Пальцева 250 млн рублей

Fix Price подготовил всё необходимое к 1 сентября

Алгоритмы Яндекс Музыки. Алгоритмы продвижения в Яндекс Музыка.


На МКАД в Москве произошло массовое ДТП, движение затруднено

В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД

В столичном главке Росгвардии проведён смотр спецтехники


Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры

"Ультиматум Трампа: потенциальные последствия для Путина"

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем


Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Штамм коронавируса "стратус" захватил 22% всех вирусных заболеваний в Москве

Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса



Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.

Пластический хирург Софья Абдулаева: подтяжка груди нитями - эффективно ли это

Utrace запускает услугу по валидации IT-систем для фармацевтического рынка

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек


Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России

"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

Две трети россиян считают, что спортсмены зарабатывают слишком много

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего


Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве

Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.


Сергей Собянин. Главное за день

Сергей Собянин осмотрел Дом-музей Федора Конюхова

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике


Исследование выявило снижение инвестиций в экологически чистую энергетику США.

Москвичи теперь должны платить за зарядку своих электромобилей

В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин


Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего

Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена

Ученый Толстых объяснил, что московские ливни вызваны мощным атлантическим циклоном


В Архангельске началось обучение бойцов СВО, сообщил Цыбульский.

70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


Прогноз погоды в Крыму на 25 июля

Россияне выбирают Крым для отдыха с детьми – названы города-лидеры

Лавандовое поле горит в Симферопольском районе Крыма

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму


Как мы в Fix Price автоматизировали создание рекламных видео

Синоптик Тишковец: череда тропических ливней в Москве завершена

В Самарской области за полгода открыто 410 вакансий для сисадминов, что на 22% меньше, чем годом ранее

Сотрудники органов принудительного исполнения обеспечивают безопасность судебных процессов














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *