Добавить новость
smi24.net
News in English
Май
2024

Efficient wastewater sample filtration improves the detection of SARS-CoV-2 variants: An extensive analysis based on sequencing parameters

0

by Angelo Robotto, Carlotta Olivero, Elisa Pozzi, Claudia Strumia, Camilla Crasà, Cristina Fedele, Maddalena Derosa, Massimo Di Martino, Stefania Latino, Giada Scorza, Andrea Civra, David Lembo, Paola Quaglino, Enrico Brizio, Denis Polato

During the SARS-CoV-2 pandemic, many countries established wastewater (WW) surveillance to objectively monitor the level of infection within the population. As new variants continue to emerge, it has become clear that WW surveillance is an essential tool for the early detection of variants. The EU Commission published a recommendation suggesting an approach to establish surveillance of SARS-CoV-2 and its variants in WW, besides specifying the methodology for WW concentration and RNA extraction. Therefore, different groups have approached the issue with different strategies, mainly focusing on WW concentration methods, but only a few groups highlighted the importance of prefiltering WW samples and/or purification of RNA samples. Aiming to obtain high-quality sequencing data allowing variants detection, we compared four experimental conditions generated from the treatment of: i) WW samples by WW filtration and ii) the extracted RNA by DNase treatment, purification and concentration of the extracted RNA. To evaluate the best condition, the results were assessed by focusing on several sequencing parameters, as the outcome of SARS-CoV-2 sequencing from WW is crucial for variant detection. Overall, the best sequencing result was obtained by filtering the WW sample. Moreover, the present study provides an overview of some sequencing parameters to consider when optimizing a method for monitoring SARS-CoV-2 variants from WW samples, which can also be applied to any sample preparation methodology.







Рэпер Баста открыл свой ресторан в Marins Park Hotel Екатеринбург

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Любовь в сердце и в «Тропикана Парк»

118 лет назад, 25 июля 1907 года, Ставропольская психиатрическая больница приняла первых 47 пациентов


Félix Auger-Aliassime

Las 'Guerreras del Agua' se dan un baño de bronce en el Mundial de Singapur

Adil Rami carga contra Lamine: "No puedo ni verlo, que le den..."

Why Juventus spent 111m this summer for only one new player


Дивеево ..

Какие зарплаты нужны для получения льготного автокредита в 2025 году

Предрассветная Нёнокса...

Вредоносный код в Firefox: атака на цепочку поставок через NPM-пакеты


Краткая биографическая справка о центральных персонажах Mafia: The Old Country

Brütal Legend is free in honor of Ozzy Osbourne, but only for 666 minutes

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

'I destroyed months of your work in seconds' says AI coding tool after deleting a devs entire database during a code freeze: 'I panicked instead of thinking'



Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Автоэксперт Олег Мосеев: автопарк России на 71,3% состоит из машин старше 10 лет

ДельтаЛизинг продолжает раскрывать секреты успеха российских предпринимателей

Более 800 студентов прошли практику на предприятиях «Швабе» в 2025 году

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»


Гарбузов: виртуальный лифт КМЗ станет экспонатом выставки «Та самая Москва»

Группа Аквилон передала государству первые квартиры

«Спартак» и «Балтика» забьют друг другу. «Спартак» — «Балтика»: прогноз и ставка

Несколько автомобилей столкнулись на внешней стороне 92-го км МКАД


Медведев пробился в четвертьфинал турнира в Вашингтоне

Алекс де Минор вышел в 1/8 финала турнира ATP-500 в Вашингтоне

Винус Уильямс: Если Серена вернется, она даст вам знать

Болбой раздавил спасенного теннисисткой Cаккари жука на турнире WTA-500 в США


Гарбузов: виртуальный лифт КМЗ станет экспонатом выставки «Та самая Москва»

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»

Группа Аквилон передала государству первые квартиры

Пир на Волге и новый штамм ковида: главные новости Ярославля за 24 июля


Музыкальные новости

Sky News: умерший Осборн с 2019 года страдал от травмы позвоночника

«Чем твои генералы лучше студентов?»: как Владимир Высоцкий выступал в Калинине

Баста, Слава и Шура снимутся в новом документальном сериале «Вирус попсы»

Где похоронен Владимир Высоцкий


В Третьяковке на Кадашевской набережной открылся концертный зал

В Москве завершился сбор с руководителями финансово-экономических подразделений Центрального округа Росгвардии

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве

Оркестр полиции Республики Сербской впервые выступит на фестивале «Спасская башня» в Москве


Путин прибыл на прощание с председателем Верховного суда Подносовой

Okko и ТНТ выпустят драмеди про трёх сестёр «Хай, систерс»

Врач Поляков: Киркоров рискует сойти с ума из-за препарата для похудения

Движение к победе: в России стартует премия «Мы верим твердо в героев спорта»


Водитель Audi сбил трех пешеходов, переходивших дорогу на западе Москвы

На международном ралли «Шелковый путь – 2025» представили новое моторное масло для мотоциклистов

В Подмосковье на видео попало, как школьник на питбайке разбился в жестком ДТП

В Москве росгвардейцы оказали помощь пострадавшей в ДТП мотоциклистке (видео)


Путин отметил успех российских школьников на олимпиаде по физике.

У Путина есть роскошный подарок для Китая: США схватились за голову, узнав о нем

Сигналы становятся всё громче. Переговоры - только ширма. Главное решится не в Стамбуле

Соболезнования в связи с авиакатастрофой в Амурской области выразили зарубежные лидеры


Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Депздрав Москвы оценил ситуацию с распространением нового штамма коронавируса

В Алтайском крае распространяется новый штамм коронавируса

Новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая



Компания КИТ МЕД представляет революционный аппарат SONOQUEEN — первую в мире анатомическую HIFU-технологию для anti-age терапии в России

Депздрав Москвы: новый штамм коронавируса "стратус" фиксируют в Москве с мая

Фитнес-марафоны на паузе: суд продлил домашний арест блогеру Лерчек

Путин дал указание рассмотреть проблемы онкологии в Архангельской области.


Мединский дал неожиданный ответ на предложение Киева о встрече Путина и Зеленского 

Британский журналист: Зеленский - мелкий жулик и крыса, которому «недолго осталось» в этом мире


"Монсон о спортсменах, которые меняют гражданство в сложный период для России"

"Зенит" заключил соглашение с американским защитником Рэндольфом

"Атлетико" заключил соглашение с игроком национальной команды Словакии

«Каникулы с Росгвардией» проходят в регионах Центральной России


Лукашенко с иронией отнесся к санкциям, запрещающим ему въезд в Эстонию

Лукашенко заявил, что в Белоруссии «на всякий случай» готовятся к войне

Лукашенко поделился мнением о самой идеальной профессии.

Лукашенко посоветовал не злить его и не допускать падежа в животноводстве


Собянин поддержал проведение конкурса «Лучший книжный магазин Москвы»

Сергей Собянин поздравил москвича — победителя международной олимпиады по физике

Сергей Собянин. Главное за день

Мэр Москвы: Улучшим транспортную доступность Южного и Северного Бутова


Детеныш краснокнижной боливийской обезьяны появился на свет в Московском зоопарке

6 лет вместе. В Москве пройдет выставка, посвященная пандам Жуи и Диндин

В центре внимания: CorpSoft24 вошел в рейтинг крупнейших ИТ-компаний России

Московские студенты начали исследовать влияние климатических изменений на сток рек Ямала


Математика Савватеева возмутило заявление о "лишних" учителях

Адвокат Грачева заявила, что Седокову хотят привлечь к уголовной ответственности

Первая победа «Динамо» в сезоне? «Динамо» — «Ростов»: прогноз и ставка

Рекордный массовый женский нетворкинг: событие от «Мир Бизнес Мам»


Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

70 участников СВО в Архангельске показали мотивацию выше госслужащих — Цыбульский

Настольный термотрансферный принтер штрих-кодов iDPRT iE4P

В Нарьян-Маре из-за холодов возобновили подачу отопления в дома


Поезда "Таврия" по-прежнему задерживаются из-за ЧП в Ростовской области

В Симферополе на базе «Клинического госпиталя для ветеранов войн» функционирует гериатрический центр для пожилых людей с возрастными нарушениями

Актуальная информация о задержке поездов в Крым и обратно

"Россия дала мне возможность быть счастливым": Джефф Монсон в Крыму


После ареста иномарки в Подмосковье должник погасил задолженность по алиментным платежам

Путин призвал жёстко пресекать вмешательство извне: «Суверенитет и ценности — под защитой»

Канада намерена содействовать в формировании палестинского государства, заявил Карни.

Игровые терминалы в ТЦ: союз ради будущего














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *