Добавить новость
smi24.net
News in English
Декабрь
2024

Computational Analysis of MDR1 Variants Predicts Effect on Cancer Cells via their Effect on mRNA Folding

0

by Tal Gutman, Tamir Tuller

The P-glycoprotein efflux pump, encoded by the MDR1 gene, is an ATP-driven transporter capable of expelling a diverse array of compounds from cells. Overexpression of this protein is implicated in the multi-drug resistant phenotype observed in various cancers. Numerous studies have attempted to decipher the impact of genetic variants within MDR1 on P-glycoprotein expression, functional activity, and clinical outcomes in cancer patients. Among these, three specific single nucleotide polymorphisms—T1236C, T2677G, and T3435C - have been the focus of extensive research efforts, primarily through in vitro cell line models and clinical cohort analyses. However, the findings from these studies have been remarkably contradictory. In this study, we employ a computational, data-driven approach to systematically evaluate the effects of these three variants on principal stages of the gene expression process. Leveraging current knowledge of gene regulatory mechanisms, we elucidate potential mechanisms by which these variants could modulate P-glycoprotein levels and function. Our findings suggest that all three variants significantly change the mRNA folding in their vicinity. This change in mRNA structure is predicted to increase local translation elongation rates, but not to change the protein expression. Nonetheless, the increased translation rate near T3435C is predicted to affect the protein’s co-translational folding trajectory in the region of the second ATP binding domain. This potentially impacts P-glycoprotein conformation and function. Our study demonstrates the value of computational approaches in elucidating the functional consequences of genetic variants. This framework provides new insights into the molecular mechanisms of MDR1 variants and their potential impact on cancer prognosis and treatment resistance. Furthermore, we introduce an approach which can be systematically applied to identify mutations potentially affecting mRNA folding in pathology. We demonstrate the utility of this approach on both ClinVar and TCGA and identify hundreds of disease related variants that modify mRNA folding at essential positions.







Опасная сторона загара: дерматолог Энгельгардт о последствиях для кожи

Секреты прошлого загородного комплекса «Тропикана Парк»

Зеленая миссия примет участие в международном экоакселераторе

Рилсмейкер. Услуги Рилсмейкера. Рилсмейкер в Москве. Стоимость работы Рилсмейкера.


OpenAI warns that its new ChatGPT Agent has the ability to aid dangerous bioweapon development

American firms in China report record-low new investment plans for 2025, and doubts about their profitability

Jerome Powell is gaining some key backing on Capitol Hill from GOP senators

Tourism is increasing over prepandemic levels, overwhelming popular destinations


Проазербайджанский агент Сергей Марков в оккупированном Шуши восхищается Алиевым, пока тот унижает Россию: намечается новый «иноагент»?

Тёплый рассвет в Турчасово

«ЭР-Телеком Холдинг» автоматизировал кадровое делопроизводство с помощью HRlink и сэкономил более 50 млн рублей

Хаски на Summer Sound – выиграй билеты на Like FM


Microsoft warns of 'active attacks' on its government and business server tech, with one cybersecurity expert claiming that they should 'assume that you have been compromised'

The dairy industry would like Gen Z to drink more milk, so they made a Fortnite diner tycoon game

Bungie promises to fix Destiny 2's new metroid-style morph ball as it makes players sick and glitches out on ultrawide monitors

В демоверсию Silver Palace можно будет поиграть 3 августа в Китае



«ЭР-Телеком Холдинг» автоматизировал кадровое делопроизводство с помощью HRlink и сэкономил более 50 млн рублей

Собянин: противовоздушная оборона сбила еще один беспилотник, летевший к столице

Хаски на Summer Sound – выиграй билеты на Like FM

Axenix выводит бизнес-аналитику на новый уровень с ИИ-ассистентами в платформе In.Plan


Массовая отмена рейсов в Кольцево: что стало причиной

Интересные каналы в Telegram. Лучшие каналы в Telegram.

«Концепция родилась не сразу»: что известно о новом сезоне сериала «Метод»

Аэропорт Пулково сообщил о приеме перенаправленных из Москвы рейсов


Роскосмос опубликовал снимок циклона, который обрушился на Москву

Электросамокатчик сбил восьмилетнего мальчика в подмосковной Балашихе

В Крым и обратно 12 поездов идут с задержкой

Новости спорта: контрольный матч «Металлурга», победа Екатерины Несветаевой, Олимпийские игры 1980


Потапова не прошла во второй раунд турнира в Вашингтоне.

Вероника Кудерметова оценила экстрим-парк «Урам» в Казани

Новак Джокович проводит 900-ю неделю в топ-10 рейтинга ATP

Роман с Маратом Сафиным и внебрачная дочь: что известно о жене Алексея Воробьева Аиде Гарифуллиной


В Ульяновске впервые прошёл фестиваль-лаборатория русского фольклора «СолнцеСтой»

«Открытый микрофон»: на Сретенском бульваре работает творческий дискуссионный клуб

Свыше 190 человек пострадали в ДТП в Москве 14–20 июля

В России стартовали продажи бюджетного японского кроссовера по цене Весты


Музыкальные новости

Полина Гагарина открыла официальную часть VK Fest в Москве

Гагарина, ASTI, Лазарев. Москва встречает грандиозный музыкальный фестиваль

«Я злая, хотя, тоже женщина»: жена Басты затравила беременную блогершу

В Италии отменили концерт Гергиева 27 июля


Зеленая миссия примет участие в международном экоакселераторе

Республика Алтай вошла в десятку регионов России по развитию ипотеки

Axenix выводит бизнес-аналитику на новый уровень с ИИ-ассистентами в платформе In.Plan

Хаски на Summer Sound – выиграй билеты на Like FM


Компрессор по подписке – новая услуга на рынке оборудования

Уникальное шоу Натальи Которевой «Женщина за 50» в Москве 20 сентября

«Я о слове “тарелочница” только в Москве узнал»: Камиль Зулфугаров расскажет о новых правилах свиданий в новом сезоне шоу Stand Up на ТНТ

Внутри конверта шанс на жизнь: как проект Почты России и Национального РДКМ помогает онкобольным


Росгвардейцы задержали мужчину, подозреваемого в угоне в Подмосковье

Маршруты автобусов № 248 и 732 на западе Москвы изменили из-за упавшего дерева

Иммунолог Логина рассказала, чем опасна лишняя влага в квартире

Новая Рига продолжает удерживать статус одного из самых желанных районов


Путин дал оценку производственным результатам оборонных заводов Удмуртии.

Путин присвоил режиссеру Богомолову звание «Заслуженный деятель искусств России»

Путин удостоил Манучарова ордена "За заслуги в культуре и искусстве"

Путин потребовал от Удмуртии поднять рождаемость с 1,39 до 2,1 к 2030 году




Врач Мескина: Бактерии в Турции могут быть не только в море, но и в бассейнах

Владимир Ефимов: В рамках 47 масштабных инвестпроектов в ЗАО появятся новые производства, объекты образования, спорта и здравоохранения

Арбуз, кукуруза и холодные напитки: диетолог Садыков назвал продукты, которые портят ваш сон летом

Иммунолог Логина рассказала, чем опасна лишняя влага в квартире


Пока вы не уснули: открытая поддержка Алиевым Киева и «подзатыльник» Зеленскому от Трампа

Зеленский назвал сумму, которую планирует взыскать с России

Перед новыми переговорами? Москва отбивается от дронов, в Киеве - «реально ад»


ЦСКА и "Оренбург" сыграли со счетом 0:0 в первом туре РПЛ

Собянин объявил об открытии нового спорткомплекса в Южном Бутове

Юный спортсмен установил новый рекорд России в дистанции 400 метров.

Сергей Собянин открыл школу на 1100 мест в стремительно растущей Коммунарке


Посланник Трампа Коул рассказал, как пил водку с Лукашенко с Минске

«Выпил две рюмки, не вырвало»: юрист Трамп рассказал, как пил водку с Лукашенко ради освобождения заключенных

Самарская делегация встретится с Александром Лукашенко в рамках работы в Минске

«Выпил две рюмки, не вырвало»: юрист Трампа рассказал, как пил водку с Лукашенко ради освобождения заключенных


Собянин: противовоздушная оборона сбила еще один беспилотник, летевший к столице

Сергей Собянин открыл школу на 1100 мест в стремительно растущей Коммунарке

Собянин: Москва выделила уже более 20,5 млрд на поддержку производств

Собянин: Летевший к Москве БПЛА ликвидирован системой ПВО Минобороны


Премия достойным. Названы лучшие экотехнологии

В Москве уже более 2,4 тысячи электробусов российского производства

В Республике Алтай расследуют дело по факту очередного крушения вертолета у Телецкого озера

В северо-западной части Москвы закрыли торговый центр из-за наводнения.


В России стартовали продажи бюджетного японского кроссовера по цене Весты

Свыше 10 тыс. абитуриентов подали заявления в МГПУ за первый месяц приемной кампании

Свыше 190 человек пострадали в ДТП в Москве 14–20 июля

Российский легкоатлет в 18 лет побил державшийся с Олимпиады в Москве рекорд в беге


Архангельская область - не самое перспективное место для трудоустройства

Собянин: Первый участок Рублево-Архангельской линии метро полностью пройден

Центр подготовки личного состава Северо-Западного округа Росгвардии пополнили призывники

Девочка упала при посадке на теплоход в порту Архангельска


"Гранд сервис экспресс" сообщил о задержках 16 поездов в Крым и из Крыма

Опубликована обновлённая информация о задержке поездов в Крым и обратно

Уважаемые пассажиры!. Сегодня в пути следования задерживаются поезда

В пути следования задерживаются поезда «Таврия»


В Крым и обратно 12 поездов идут с задержкой

Синоптик Вильфанд рассказал, что не верит в метеозависимость людей

Роскосмос опубликовал снимок циклона, который обрушился на Москву

Готовьтесь к эмоциональному погружению: долгожданная аудиоверсия откровенных стихов Аннэтэс Рудман














СМИ24.net — правдивые новости, непрерывно 24/7 на русском языке с ежеминутным обновлением *