حکم تنفیذ ریاست جمهوری شهید محمدعلی رجایی در ۱۱ مرداد ۱۳۶۰ توسط امام خمینی (ره) تنفیذ شد. این حکم یک ماه قبل از شهادت ایشان در انفجار دفتر نخستوزیری در ۸ شهریور ۱۳۶۰ صادر شد.دومین دوره انتخابات ریاست جمهوری ایران ۲ مرداد ۱۳۶۰ و پس از عزل ابوالحسن بنیصدر از ریاست جمهوری و درحالی که وی هنوز در کشور بود برگزار شد. در نهایت محمدعلی رجایی با کسب ۱۲ میلیون و ۷۷۰ هزار و ۵۰ رای (۹۰٪) از مجموع ۱۴ میلیون و ۵۷۳ هزار و ۸۰۳ رای ماخوذه رئیس جمهور ایران شد. میزان مشارکت در این دوره ۶۴٫۲ درصد بود.
