Преследуемую по делу об участии в ФБК уфимскую журналистку этапировали в Москву
27 марта силовики пришли домой к Комлевой с требованием явиться на допрос по некоему уголовному делу, однако ей не вручили повестку. Журналистка решила, что интерес силовиков связан с ее освещением «Баймакского дела», возбужденного в отношении участников февральских митингов против приговора башкортскому активисту Фаилю Алсынову.
Позднее правоохранители снова пришли к ней, на этот раз с постановлением о приводе на допрос по делу против ФБК в качестве свидетельницы. Несмотря на отсутствие повестки ранее, в постановлении значилось, что повестки Комлевой «направлялись неоднократно». В момент задержания силовик предложил журналистке собрать вещи первой необходимости. Когда она уточнила, собираются ли ее арестовывать, он ответил, что это якобы не сможет сказать ни он, ни даже следователь. Уже в здании СК по Кировскому району Уфы журналистке предъявили обвинение по делу об «экстремистском сообществе»; ее задержали на 48 часов, на следующий день ее отправили под стражу.
В конце сентября 2021 года Следственный комитет сообщил, что против Навального и его соратников, а также других активистов возбуждено дело об экстремистском сообществе (ст. 282.1 УК). Позднее стало известно, что к этому делу присоединили еще несколько дел, возбужденных ранее в отношении политика и нескольких ключевых фигур в его структурах. В настоящее время в рамках одного дела, помимо статьи об экстремистском сообществе, имеются также статьи о финансировании экстремистской деятельности (ч. 1 ст. 282.3 УК), о легализации денежных средств, приобретенных другими лицами преступным путем (п. «б» ч. 4 ст. 174 УК), о создании некоммерческой организации, посягающей на личность и права граждан (ч. 2 ст. 239 УК) и о вовлечении несовершеннолетних в опасную деятельность (пп. «а», «в» ч. 2 ст. 151.2 УК). В августе 2023 года Навального приговорили к 19 годам колонии особого режима по статьям о финансировании экстремизма (ч. 2 ст. 282.3 УК), о создании экстремистского сообщества (ч. 3 ст. 282.1 УК) и о призывах к экстремизму (ч. 2 ст. 280 УК). 16 февраля политик погиб в колонии.
В рамках дела об экстремистском сообществе в январе 2023 экс-сотрудников штаба Навального в Архангельске Егора Бутакова и Елизавету Бычкову приговорили к году ограничения свободы. В июне экс-координаторку уфимского штаба Навального Лилию Чанышеву приговорили к семи с половиной годам лишения свободы, тогда же назначили два с половиной года колонии другому фигуранту этого дела, Рустема Мулюкова, которого в декабре отказались освободить, несмотря на I группу инвалидности. В июле приговор вынесли экс-координатору штаба в Барнауле Вадиму Останину — девять лет колонии общего режима, а в августе бывшему техническому директору «Навальный LIVE» Даниэлю Холодному присудили восемь лет колонии общего режима. Под арестом находятся адвокаты политика Алексей Липцер, Вадим Кобзев и Игорь Сергунин, а также фигуранты дела о «подпольных штабах Навального» Иван Трофимов и Алина Олехнович. В декабре экс-координаторку томского штаба Ксению Фадееву приговорили к девяти годам колонии. В октябре 2022 года волонтерку этого штаба Ольгу Школину заочно арестовали — летом она уехала из страны. Кроме того, в декабре того же года бывшему координатору иркутского штаба Навального Захару Сарапулову назначили год условного лишения свободы.
МВД и другие силовые ведомства регулярно подают иски к Комлевой, связанные с ее участием в акциях в поддержку Навального в 2021 году. Силовые ведомства надеются взыскать с журналистки крупные СМИ за потраченное топливо, внеурочную работу сотрудников и по другим поводам. Только в январе 2023 года число подобных исков достигло семи. Часть исков суды уже удовлетворили. Так, в конце июля 2023 года с женщины взыскали 23 тысячи рублей в пользу медсанчасти МВД. После удовлетворения этого иска, приставы также конфисковали машину Комлевой.